Protein–RNA interactions for Protein: P68371

TUBB4B, Tubulin beta-4B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4BP68371 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TUBB4BP68371 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TUBB4BP68371 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TUBB4BP68371 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TUBB4BP68371 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TUBB4BP68371 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TUBB4BP68371 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TUBB4BP68371 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TUBB4BP68371 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TUBB4BP68371 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TUBB4BP68371 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
TUBB4BP68371 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TUBB4BP68371 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TUBB4BP68371 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TUBB4BP68371 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TUBB4BP68371 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TUBB4BP68371 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TUBB4BP68371 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TUBB4BP68371 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TUBB4BP68371 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TUBB4BP68371 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TUBB4BP68371 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TUBB4BP68371 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TUBB4BP68371 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TUBB4BP68371 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TUBB4BP68371 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TUBB4BP68371 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TUBB4BP68371 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TUBB4BP68371 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TUBB4BP68371 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TUBB4BP68371 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TUBB4BP68371 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TUBB4BP68371 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TUBB4BP68371 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TUBB4BP68371 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TUBB4BP68371 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TUBB4BP68371 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TUBB4BP68371 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TUBB4BP68371 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TUBB4BP68371 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TUBB4BP68371 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TUBB4BP68371 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TUBB4BP68371 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TUBB4BP68371 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TUBB4BP68371 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TUBB4BP68371 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TUBB4BP68371 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TUBB4BP68371 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TUBB4BP68371 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TUBB4BP68371 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TUBB4BP68371 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TUBB4BP68371 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TUBB4BP68371 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TUBB4BP68371 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TUBB4BP68371 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TUBB4BP68371 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TUBB4BP68371 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TUBB4BP68371 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TUBB4BP68371 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TUBB4BP68371 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TUBB4BP68371 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TUBB4BP68371 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TUBB4BP68371 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TUBB4BP68371 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TUBB4BP68371 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TUBB4BP68371 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TUBB4BP68371 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TUBB4BP68371 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TUBB4BP68371 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TUBB4BP68371 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TUBB4BP68371 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TUBB4BP68371 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TUBB4BP68371 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TUBB4BP68371 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TUBB4BP68371 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TUBB4BP68371 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TUBB4BP68371 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TUBB4BP68371 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TUBB4BP68371 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TUBB4BP68371 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TUBB4BP68371 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TUBB4BP68371 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TUBB4BP68371 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TUBB4BP68371 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TUBB4BP68371 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TUBB4BP68371 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TUBB4BP68371 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TUBB4BP68371 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TUBB4BP68371 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TUBB4BP68371 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TUBB4BP68371 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TUBB4BP68371 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TUBB4BP68371 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TUBB4BP68371 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TUBB4BP68371 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TUBB4BP68371 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TUBB4BP68371 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TUBB4BP68371 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TUBB4BP68371 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TUBB4BP68371 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms