Protein–RNA interactions for Protein: P63132

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63132 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HERVK_113P63132 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HERVK_113P63132 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HERVK_113P63132 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HERVK_113P63132 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HERVK_113P63132 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HERVK_113P63132 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HERVK_113P63132 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HERVK_113P63132 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HERVK_113P63132 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HERVK_113P63132 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HERVK_113P63132 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HERVK_113P63132 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HERVK_113P63132 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HERVK_113P63132 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HERVK_113P63132 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HERVK_113P63132 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
HERVK_113P63132 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
HERVK_113P63132 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HERVK_113P63132 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HERVK_113P63132 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HERVK_113P63132 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HERVK_113P63132 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HERVK_113P63132 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HERVK_113P63132 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HERVK_113P63132 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HERVK_113P63132 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HERVK_113P63132 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HERVK_113P63132 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HERVK_113P63132 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HERVK_113P63132 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HERVK_113P63132 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HERVK_113P63132 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HERVK_113P63132 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HERVK_113P63132 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HERVK_113P63132 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HERVK_113P63132 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HERVK_113P63132 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HERVK_113P63132 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HERVK_113P63132 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HERVK_113P63132 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HERVK_113P63132 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HERVK_113P63132 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HERVK_113P63132 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HERVK_113P63132 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HERVK_113P63132 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HERVK_113P63132 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HERVK_113P63132 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HERVK_113P63132 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HERVK_113P63132 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HERVK_113P63132 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HERVK_113P63132 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HERVK_113P63132 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HERVK_113P63132 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HERVK_113P63132 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HERVK_113P63132 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HERVK_113P63132 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HERVK_113P63132 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HERVK_113P63132 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HERVK_113P63132 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HERVK_113P63132 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
HERVK_113P63132 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HERVK_113P63132 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HERVK_113P63132 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HERVK_113P63132 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HERVK_113P63132 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HERVK_113P63132 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HERVK_113P63132 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HERVK_113P63132 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HERVK_113P63132 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
HERVK_113P63132 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
HERVK_113P63132 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HERVK_113P63132 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HERVK_113P63132 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
HERVK_113P63132 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HERVK_113P63132 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HERVK_113P63132 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HERVK_113P63132 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HERVK_113P63132 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
HERVK_113P63132 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HERVK_113P63132 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HERVK_113P63132 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HERVK_113P63132 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HERVK_113P63132 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HERVK_113P63132 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HERVK_113P63132 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HERVK_113P63132 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
HERVK_113P63132 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HERVK_113P63132 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HERVK_113P63132 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HERVK_113P63132 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HERVK_113P63132 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HERVK_113P63132 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HERVK_113P63132 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HERVK_113P63132 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
HERVK_113P63132 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HERVK_113P63132 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HERVK_113P63132 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HERVK_113P63132 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
HERVK_113P63132 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 264.5 ms