Protein–RNA interactions for Protein: P61201

COPS2, COP9 signalosome complex subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS2P61201 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
COPS2P61201 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
COPS2P61201 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
COPS2P61201 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
COPS2P61201 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
COPS2P61201 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
COPS2P61201 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
COPS2P61201 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
COPS2P61201 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
COPS2P61201 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
COPS2P61201 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
COPS2P61201 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
COPS2P61201 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
COPS2P61201 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
COPS2P61201 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
COPS2P61201 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
COPS2P61201 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
COPS2P61201 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
COPS2P61201 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
COPS2P61201 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
COPS2P61201 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
COPS2P61201 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
COPS2P61201 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
COPS2P61201 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
COPS2P61201 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
COPS2P61201 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
COPS2P61201 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
COPS2P61201 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
COPS2P61201 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
COPS2P61201 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
COPS2P61201 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
COPS2P61201 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
COPS2P61201 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
COPS2P61201 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
COPS2P61201 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
COPS2P61201 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
COPS2P61201 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
COPS2P61201 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
COPS2P61201 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
COPS2P61201 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
COPS2P61201 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
COPS2P61201 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
COPS2P61201 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
COPS2P61201 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
COPS2P61201 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
COPS2P61201 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
COPS2P61201 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
COPS2P61201 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
COPS2P61201 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
COPS2P61201 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
COPS2P61201 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
COPS2P61201 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
COPS2P61201 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
COPS2P61201 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
COPS2P61201 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
COPS2P61201 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
COPS2P61201 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
COPS2P61201 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
COPS2P61201 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
COPS2P61201 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
COPS2P61201 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
COPS2P61201 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
COPS2P61201 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
COPS2P61201 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
COPS2P61201 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
COPS2P61201 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
COPS2P61201 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
COPS2P61201 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
COPS2P61201 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
COPS2P61201 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
COPS2P61201 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
COPS2P61201 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
COPS2P61201 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
COPS2P61201 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
COPS2P61201 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
COPS2P61201 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
COPS2P61201 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
COPS2P61201 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
COPS2P61201 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
COPS2P61201 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
COPS2P61201 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
COPS2P61201 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
COPS2P61201 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
COPS2P61201 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
COPS2P61201 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
COPS2P61201 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
COPS2P61201 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
COPS2P61201 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
COPS2P61201 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
COPS2P61201 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
COPS2P61201 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
COPS2P61201 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
COPS2P61201 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
COPS2P61201 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
COPS2P61201 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
COPS2P61201 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
COPS2P61201 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
COPS2P61201 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
COPS2P61201 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
COPS2P61201 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms