Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ACTBP60709 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ACTBP60709 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ACTBP60709 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ACTBP60709 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
ACTBP60709 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ACTBP60709 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ACTBP60709 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ACTBP60709 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ACTBP60709 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ACTBP60709 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ACTBP60709 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ACTBP60709 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ACTBP60709 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ACTBP60709 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ACTBP60709 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ACTBP60709 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ACTBP60709 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ACTBP60709 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ACTBP60709 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ACTBP60709 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ACTBP60709 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ACTBP60709 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ACTBP60709 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ACTBP60709 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ACTBP60709 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ACTBP60709 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
ACTBP60709 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ACTBP60709 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ACTBP60709 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ACTBP60709 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ACTBP60709 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
ACTBP60709 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ACTBP60709 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ACTBP60709 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ACTBP60709 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ACTBP60709 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ACTBP60709 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ACTBP60709 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ACTBP60709 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ACTBP60709 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ACTBP60709 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ACTBP60709 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ACTBP60709 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ACTBP60709 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ACTBP60709 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ACTBP60709 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ACTBP60709 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ACTBP60709 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ACTBP60709 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ACTBP60709 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ACTBP60709 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ACTBP60709 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ACTBP60709 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ACTBP60709 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ACTBP60709 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
ACTBP60709 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ACTBP60709 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ACTBP60709 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ACTBP60709 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ACTBP60709 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
ACTBP60709 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ACTBP60709 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ACTBP60709 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ACTBP60709 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ACTBP60709 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ACTBP60709 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ACTBP60709 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ACTBP60709 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ACTBP60709 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ACTBP60709 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ACTBP60709 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ACTBP60709 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ACTBP60709 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ACTBP60709 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ACTBP60709 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ACTBP60709 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ACTBP60709 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ACTBP60709 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ACTBP60709 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ACTBP60709 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ACTBP60709 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ACTBP60709 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ACTBP60709 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ACTBP60709 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ACTBP60709 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
ACTBP60709 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ACTBP60709 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ACTBP60709 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ACTBP60709 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ACTBP60709 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ACTBP60709 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ACTBP60709 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ACTBP60709 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ACTBP60709 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ACTBP60709 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ACTBP60709 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ACTBP60709 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ACTBP60709 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ACTBP60709 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms