Protein–RNA interactions for Protein: P58513

LINC00158, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00158, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00158P58513 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00158P58513 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00158P58513 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00158P58513 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00158P58513 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00158P58513 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00158P58513 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00158P58513 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00158P58513 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00158P58513 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00158P58513 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00158P58513 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00158P58513 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00158P58513 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00158P58513 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00158P58513 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00158P58513 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00158P58513 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00158P58513 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00158P58513 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00158P58513 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00158P58513 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00158P58513 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00158P58513 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00158P58513 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00158P58513 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00158P58513 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00158P58513 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00158P58513 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00158P58513 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00158P58513 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00158P58513 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00158P58513 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00158P58513 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00158P58513 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00158P58513 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00158P58513 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00158P58513 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00158P58513 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00158P58513 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00158P58513 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00158P58513 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00158P58513 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00158P58513 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00158P58513 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00158P58513 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00158P58513 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00158P58513 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00158P58513 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00158P58513 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00158P58513 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00158P58513 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00158P58513 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00158P58513 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00158P58513 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00158P58513 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00158P58513 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00158P58513 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00158P58513 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00158P58513 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00158P58513 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00158P58513 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00158P58513 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00158P58513 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00158P58513 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00158P58513 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00158P58513 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00158P58513 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00158P58513 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00158P58513 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00158P58513 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00158P58513 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00158P58513 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00158P58513 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00158P58513 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00158P58513 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00158P58513 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00158P58513 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00158P58513 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00158P58513 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00158P58513 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00158P58513 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00158P58513 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00158P58513 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00158P58513 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00158P58513 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00158P58513 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00158P58513 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00158P58513 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00158P58513 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00158P58513 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00158P58513 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00158P58513 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00158P58513 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00158P58513 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00158P58513 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00158P58513 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00158P58513 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00158P58513 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00158P58513 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms