Protein–RNA interactions for Protein: P57678

GEMIN4, Gem-associated protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,058 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEMIN4P57678 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GEMIN4P57678 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GEMIN4P57678 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
GEMIN4P57678 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
GEMIN4P57678 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GEMIN4P57678 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
GEMIN4P57678 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GEMIN4P57678 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GEMIN4P57678 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GEMIN4P57678 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GEMIN4P57678 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GEMIN4P57678 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GEMIN4P57678 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GEMIN4P57678 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GEMIN4P57678 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GEMIN4P57678 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GEMIN4P57678 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GEMIN4P57678 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GEMIN4P57678 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GEMIN4P57678 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GEMIN4P57678 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GEMIN4P57678 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GEMIN4P57678 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GEMIN4P57678 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GEMIN4P57678 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
GEMIN4P57678 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GEMIN4P57678 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GEMIN4P57678 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GEMIN4P57678 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GEMIN4P57678 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GEMIN4P57678 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GEMIN4P57678 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GEMIN4P57678 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GEMIN4P57678 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GEMIN4P57678 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GEMIN4P57678 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GEMIN4P57678 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GEMIN4P57678 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GEMIN4P57678 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GEMIN4P57678 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GEMIN4P57678 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GEMIN4P57678 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GEMIN4P57678 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GEMIN4P57678 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GEMIN4P57678 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GEMIN4P57678 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GEMIN4P57678 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GEMIN4P57678 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
GEMIN4P57678 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GEMIN4P57678 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GEMIN4P57678 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GEMIN4P57678 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GEMIN4P57678 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GEMIN4P57678 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GEMIN4P57678 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GEMIN4P57678 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GEMIN4P57678 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GEMIN4P57678 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GEMIN4P57678 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GEMIN4P57678 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GEMIN4P57678 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GEMIN4P57678 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GEMIN4P57678 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GEMIN4P57678 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GEMIN4P57678 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GEMIN4P57678 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GEMIN4P57678 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GEMIN4P57678 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GEMIN4P57678 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GEMIN4P57678 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GEMIN4P57678 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GEMIN4P57678 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GEMIN4P57678 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GEMIN4P57678 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GEMIN4P57678 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GEMIN4P57678 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GEMIN4P57678 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GEMIN4P57678 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GEMIN4P57678 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GEMIN4P57678 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
GEMIN4P57678 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GEMIN4P57678 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GEMIN4P57678 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GEMIN4P57678 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GEMIN4P57678 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
GEMIN4P57678 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GEMIN4P57678 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GEMIN4P57678 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GEMIN4P57678 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GEMIN4P57678 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GEMIN4P57678 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GEMIN4P57678 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GEMIN4P57678 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GEMIN4P57678 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
GEMIN4P57678 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GEMIN4P57678 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GEMIN4P57678 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
GEMIN4P57678 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GEMIN4P57678 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GEMIN4P57678 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms