Protein–RNA interactions for Protein: P57087

JAM2, Junctional adhesion molecule B, humanhuman

Predictions only

Length 298 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JAM2P57087 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
JAM2P57087 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
JAM2P57087 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
JAM2P57087 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
JAM2P57087 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
JAM2P57087 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
JAM2P57087 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
JAM2P57087 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
JAM2P57087 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
JAM2P57087 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
JAM2P57087 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
JAM2P57087 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
JAM2P57087 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
JAM2P57087 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
JAM2P57087 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
JAM2P57087 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
JAM2P57087 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
JAM2P57087 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
JAM2P57087 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
JAM2P57087 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
JAM2P57087 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
JAM2P57087 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
JAM2P57087 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
JAM2P57087 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
JAM2P57087 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
JAM2P57087 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
JAM2P57087 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
JAM2P57087 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
JAM2P57087 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
JAM2P57087 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
JAM2P57087 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
JAM2P57087 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
JAM2P57087 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
JAM2P57087 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
JAM2P57087 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
JAM2P57087 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
JAM2P57087 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
JAM2P57087 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
JAM2P57087 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
JAM2P57087 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
JAM2P57087 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
JAM2P57087 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
JAM2P57087 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
JAM2P57087 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
JAM2P57087 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
JAM2P57087 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
JAM2P57087 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
JAM2P57087 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
JAM2P57087 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
JAM2P57087 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
JAM2P57087 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
JAM2P57087 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
JAM2P57087 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
JAM2P57087 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
JAM2P57087 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
JAM2P57087 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
JAM2P57087 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
JAM2P57087 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
JAM2P57087 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
JAM2P57087 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
JAM2P57087 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
JAM2P57087 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
JAM2P57087 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
JAM2P57087 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
JAM2P57087 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
JAM2P57087 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
JAM2P57087 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
JAM2P57087 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
JAM2P57087 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
JAM2P57087 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
JAM2P57087 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
JAM2P57087 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
JAM2P57087 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
JAM2P57087 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
JAM2P57087 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
JAM2P57087 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
JAM2P57087 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
JAM2P57087 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
JAM2P57087 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
JAM2P57087 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
JAM2P57087 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
JAM2P57087 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
JAM2P57087 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
JAM2P57087 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
JAM2P57087 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
JAM2P57087 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
JAM2P57087 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
JAM2P57087 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
JAM2P57087 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
JAM2P57087 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
JAM2P57087 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
JAM2P57087 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
JAM2P57087 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
JAM2P57087 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
JAM2P57087 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
JAM2P57087 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
JAM2P57087 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
JAM2P57087 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
JAM2P57087 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
JAM2P57087 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms