Protein–RNA interactions for Protein: P55286

CDH8, Cadherin-8, humanhuman

Predictions only

Length 799 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH8P55286 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDH8P55286 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDH8P55286 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDH8P55286 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDH8P55286 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDH8P55286 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDH8P55286 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDH8P55286 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDH8P55286 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDH8P55286 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDH8P55286 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDH8P55286 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CDH8P55286 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDH8P55286 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDH8P55286 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CDH8P55286 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CDH8P55286 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDH8P55286 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDH8P55286 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDH8P55286 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDH8P55286 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDH8P55286 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDH8P55286 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDH8P55286 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDH8P55286 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDH8P55286 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDH8P55286 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDH8P55286 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDH8P55286 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDH8P55286 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDH8P55286 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDH8P55286 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDH8P55286 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDH8P55286 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDH8P55286 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDH8P55286 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDH8P55286 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDH8P55286 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDH8P55286 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDH8P55286 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CDH8P55286 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDH8P55286 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDH8P55286 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDH8P55286 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDH8P55286 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDH8P55286 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDH8P55286 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDH8P55286 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDH8P55286 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CDH8P55286 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDH8P55286 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDH8P55286 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDH8P55286 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDH8P55286 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDH8P55286 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDH8P55286 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDH8P55286 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDH8P55286 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDH8P55286 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDH8P55286 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDH8P55286 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDH8P55286 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDH8P55286 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDH8P55286 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDH8P55286 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDH8P55286 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDH8P55286 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDH8P55286 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDH8P55286 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDH8P55286 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CDH8P55286 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDH8P55286 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CDH8P55286 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDH8P55286 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CDH8P55286 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDH8P55286 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDH8P55286 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CDH8P55286 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CDH8P55286 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDH8P55286 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDH8P55286 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDH8P55286 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDH8P55286 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDH8P55286 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDH8P55286 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CDH8P55286 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDH8P55286 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDH8P55286 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDH8P55286 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDH8P55286 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDH8P55286 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDH8P55286 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDH8P55286 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDH8P55286 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDH8P55286 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDH8P55286 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDH8P55286 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDH8P55286 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDH8P55286 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDH8P55286 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms