Protein–RNA interactions for Protein: P53367

ARFIP1, Arfaptin-1, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFIP1P53367 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARFIP1P53367 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARFIP1P53367 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARFIP1P53367 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARFIP1P53367 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARFIP1P53367 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARFIP1P53367 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARFIP1P53367 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARFIP1P53367 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARFIP1P53367 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARFIP1P53367 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARFIP1P53367 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARFIP1P53367 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARFIP1P53367 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARFIP1P53367 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ARFIP1P53367 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ARFIP1P53367 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ARFIP1P53367 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
ARFIP1P53367 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ARFIP1P53367 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ARFIP1P53367 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ARFIP1P53367 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ARFIP1P53367 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ARFIP1P53367 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ARFIP1P53367 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARFIP1P53367 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARFIP1P53367 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARFIP1P53367 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARFIP1P53367 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARFIP1P53367 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARFIP1P53367 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARFIP1P53367 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARFIP1P53367 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARFIP1P53367 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARFIP1P53367 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARFIP1P53367 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
ARFIP1P53367 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARFIP1P53367 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARFIP1P53367 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARFIP1P53367 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARFIP1P53367 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARFIP1P53367 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARFIP1P53367 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARFIP1P53367 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ARFIP1P53367 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARFIP1P53367 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARFIP1P53367 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ARFIP1P53367 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARFIP1P53367 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARFIP1P53367 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARFIP1P53367 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARFIP1P53367 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARFIP1P53367 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ARFIP1P53367 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ARFIP1P53367 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ARFIP1P53367 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ARFIP1P53367 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ARFIP1P53367 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ARFIP1P53367 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ARFIP1P53367 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ARFIP1P53367 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ARFIP1P53367 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ARFIP1P53367 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ARFIP1P53367 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ARFIP1P53367 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ARFIP1P53367 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ARFIP1P53367 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ARFIP1P53367 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ARFIP1P53367 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ARFIP1P53367 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ARFIP1P53367 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ARFIP1P53367 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ARFIP1P53367 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ARFIP1P53367 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ARFIP1P53367 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ARFIP1P53367 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ARFIP1P53367 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ARFIP1P53367 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ARFIP1P53367 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ARFIP1P53367 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ARFIP1P53367 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ARFIP1P53367 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
ARFIP1P53367 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ARFIP1P53367 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ARFIP1P53367 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ARFIP1P53367 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ARFIP1P53367 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ARFIP1P53367 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ARFIP1P53367 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ARFIP1P53367 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ARFIP1P53367 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ARFIP1P53367 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ARFIP1P53367 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ARFIP1P53367 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ARFIP1P53367 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ARFIP1P53367 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ARFIP1P53367 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ARFIP1P53367 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ARFIP1P53367 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ARFIP1P53367 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms