Protein–RNA interactions for Protein: P52744

ZNF138, Zinc finger protein 138, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF138P52744 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF138P52744 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF138P52744 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF138P52744 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF138P52744 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF138P52744 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF138P52744 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF138P52744 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF138P52744 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF138P52744 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF138P52744 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF138P52744 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZNF138P52744 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZNF138P52744 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZNF138P52744 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZNF138P52744 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZNF138P52744 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNF138P52744 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNF138P52744 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNF138P52744 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNF138P52744 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNF138P52744 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNF138P52744 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNF138P52744 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNF138P52744 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNF138P52744 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF138P52744 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF138P52744 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF138P52744 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF138P52744 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF138P52744 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF138P52744 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF138P52744 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF138P52744 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF138P52744 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF138P52744 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF138P52744 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF138P52744 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF138P52744 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF138P52744 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF138P52744 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF138P52744 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF138P52744 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF138P52744 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF138P52744 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF138P52744 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF138P52744 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF138P52744 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF138P52744 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF138P52744 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF138P52744 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF138P52744 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF138P52744 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF138P52744 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF138P52744 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF138P52744 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF138P52744 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF138P52744 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF138P52744 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF138P52744 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF138P52744 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF138P52744 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF138P52744 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF138P52744 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF138P52744 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF138P52744 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF138P52744 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF138P52744 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF138P52744 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF138P52744 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF138P52744 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF138P52744 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF138P52744 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF138P52744 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF138P52744 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF138P52744 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF138P52744 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF138P52744 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF138P52744 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF138P52744 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF138P52744 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF138P52744 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF138P52744 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF138P52744 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF138P52744 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF138P52744 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF138P52744 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF138P52744 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF138P52744 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNF138P52744 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNF138P52744 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNF138P52744 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNF138P52744 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNF138P52744 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNF138P52744 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNF138P52744 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ZNF138P52744 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
ZNF138P52744 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF138P52744 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF138P52744 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms