Protein–RNA interactions for Protein: P52435

POLR2J, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2JP52435 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR2JP52435 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR2JP52435 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR2JP52435 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR2JP52435 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR2JP52435 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR2JP52435 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR2JP52435 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR2JP52435 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
POLR2JP52435 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLR2JP52435 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLR2JP52435 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLR2JP52435 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLR2JP52435 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLR2JP52435 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLR2JP52435 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLR2JP52435 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLR2JP52435 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLR2JP52435 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLR2JP52435 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
POLR2JP52435 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLR2JP52435 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLR2JP52435 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLR2JP52435 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLR2JP52435 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
POLR2JP52435 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
POLR2JP52435 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
POLR2JP52435 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
POLR2JP52435 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
POLR2JP52435 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
POLR2JP52435 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
POLR2JP52435 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
POLR2JP52435 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLR2JP52435 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
POLR2JP52435 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLR2JP52435 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLR2JP52435 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLR2JP52435 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLR2JP52435 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLR2JP52435 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLR2JP52435 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLR2JP52435 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLR2JP52435 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLR2JP52435 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLR2JP52435 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLR2JP52435 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLR2JP52435 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLR2JP52435 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLR2JP52435 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLR2JP52435 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLR2JP52435 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLR2JP52435 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
POLR2JP52435 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
POLR2JP52435 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
POLR2JP52435 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
POLR2JP52435 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
POLR2JP52435 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
POLR2JP52435 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR2JP52435 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR2JP52435 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR2JP52435 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR2JP52435 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR2JP52435 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR2JP52435 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
POLR2JP52435 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
POLR2JP52435 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
POLR2JP52435 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR2JP52435 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR2JP52435 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR2JP52435 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR2JP52435 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR2JP52435 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR2JP52435 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR2JP52435 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR2JP52435 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR2JP52435 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR2JP52435 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR2JP52435 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR2JP52435 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR2JP52435 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR2JP52435 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR2JP52435 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR2JP52435 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
POLR2JP52435 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
POLR2JP52435 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
POLR2JP52435 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
POLR2JP52435 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
POLR2JP52435 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
POLR2JP52435 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
POLR2JP52435 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
POLR2JP52435 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
POLR2JP52435 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
POLR2JP52435 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
POLR2JP52435 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
POLR2JP52435 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
POLR2JP52435 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
POLR2JP52435 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR2JP52435 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR2JP52435 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR2JP52435 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
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