Protein–RNA interactions for Protein: P51801

CLCNKB, Chloride channel protein ClC-Kb, humanhuman

Predictions only

Length 687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCNKBP51801 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLCNKBP51801 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLCNKBP51801 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLCNKBP51801 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLCNKBP51801 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CLCNKBP51801 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLCNKBP51801 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLCNKBP51801 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLCNKBP51801 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLCNKBP51801 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLCNKBP51801 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLCNKBP51801 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLCNKBP51801 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLCNKBP51801 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLCNKBP51801 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLCNKBP51801 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLCNKBP51801 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLCNKBP51801 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLCNKBP51801 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLCNKBP51801 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CLCNKBP51801 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLCNKBP51801 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLCNKBP51801 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLCNKBP51801 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLCNKBP51801 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CLCNKBP51801 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLCNKBP51801 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLCNKBP51801 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLCNKBP51801 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLCNKBP51801 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLCNKBP51801 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLCNKBP51801 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLCNKBP51801 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLCNKBP51801 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLCNKBP51801 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLCNKBP51801 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLCNKBP51801 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLCNKBP51801 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLCNKBP51801 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CLCNKBP51801 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CLCNKBP51801 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CLCNKBP51801 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLCNKBP51801 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CLCNKBP51801 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLCNKBP51801 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLCNKBP51801 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLCNKBP51801 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLCNKBP51801 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLCNKBP51801 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLCNKBP51801 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLCNKBP51801 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLCNKBP51801 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CLCNKBP51801 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLCNKBP51801 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CLCNKBP51801 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLCNKBP51801 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CLCNKBP51801 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLCNKBP51801 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLCNKBP51801 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLCNKBP51801 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLCNKBP51801 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLCNKBP51801 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLCNKBP51801 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLCNKBP51801 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLCNKBP51801 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLCNKBP51801 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLCNKBP51801 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLCNKBP51801 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLCNKBP51801 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLCNKBP51801 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLCNKBP51801 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLCNKBP51801 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLCNKBP51801 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLCNKBP51801 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLCNKBP51801 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLCNKBP51801 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLCNKBP51801 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLCNKBP51801 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLCNKBP51801 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLCNKBP51801 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLCNKBP51801 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLCNKBP51801 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CLCNKBP51801 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CLCNKBP51801 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CLCNKBP51801 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CLCNKBP51801 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CLCNKBP51801 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CLCNKBP51801 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CLCNKBP51801 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLCNKBP51801 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLCNKBP51801 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLCNKBP51801 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLCNKBP51801 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLCNKBP51801 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLCNKBP51801 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLCNKBP51801 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLCNKBP51801 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLCNKBP51801 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLCNKBP51801 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CLCNKBP51801 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms