Protein–RNA interactions for Protein: P50549

ETV1, ETS translocation variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV1P50549 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ETV1P50549 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ETV1P50549 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ETV1P50549 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ETV1P50549 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ETV1P50549 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ETV1P50549 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ETV1P50549 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ETV1P50549 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ETV1P50549 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ETV1P50549 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ETV1P50549 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ETV1P50549 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ETV1P50549 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ETV1P50549 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ETV1P50549 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ETV1P50549 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
ETV1P50549 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ETV1P50549 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ETV1P50549 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ETV1P50549 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ETV1P50549 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ETV1P50549 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ETV1P50549 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ETV1P50549 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ETV1P50549 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ETV1P50549 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ETV1P50549 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ETV1P50549 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ETV1P50549 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ETV1P50549 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ETV1P50549 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
ETV1P50549 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ETV1P50549 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ETV1P50549 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ETV1P50549 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ETV1P50549 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ETV1P50549 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ETV1P50549 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
ETV1P50549 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ETV1P50549 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ETV1P50549 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ETV1P50549 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ETV1P50549 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ETV1P50549 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ETV1P50549 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ETV1P50549 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ETV1P50549 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ETV1P50549 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ETV1P50549 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ETV1P50549 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ETV1P50549 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ETV1P50549 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ETV1P50549 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ETV1P50549 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ETV1P50549 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ETV1P50549 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ETV1P50549 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ETV1P50549 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ETV1P50549 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ETV1P50549 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ETV1P50549 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ETV1P50549 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ETV1P50549 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ETV1P50549 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ETV1P50549 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ETV1P50549 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ETV1P50549 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ETV1P50549 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ETV1P50549 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ETV1P50549 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ETV1P50549 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ETV1P50549 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ETV1P50549 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ETV1P50549 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ETV1P50549 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ETV1P50549 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ETV1P50549 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ETV1P50549 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ETV1P50549 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ETV1P50549 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ETV1P50549 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ETV1P50549 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ETV1P50549 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ETV1P50549 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ETV1P50549 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ETV1P50549 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ETV1P50549 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ETV1P50549 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ETV1P50549 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ETV1P50549 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ETV1P50549 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ETV1P50549 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ETV1P50549 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ETV1P50549 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ETV1P50549 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ETV1P50549 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ETV1P50549 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ETV1P50549 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ETV1P50549 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms