Protein–RNA interactions for Protein: P49447

CYB561, Cytochrome b561, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYB561P49447 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CYB561P49447 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CYB561P49447 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CYB561P49447 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CYB561P49447 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CYB561P49447 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CYB561P49447 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CYB561P49447 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CYB561P49447 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CYB561P49447 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CYB561P49447 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CYB561P49447 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CYB561P49447 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CYB561P49447 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CYB561P49447 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CYB561P49447 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CYB561P49447 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CYB561P49447 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CYB561P49447 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CYB561P49447 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CYB561P49447 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CYB561P49447 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CYB561P49447 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CYB561P49447 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CYB561P49447 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CYB561P49447 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CYB561P49447 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CYB561P49447 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CYB561P49447 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CYB561P49447 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CYB561P49447 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CYB561P49447 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CYB561P49447 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CYB561P49447 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CYB561P49447 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CYB561P49447 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CYB561P49447 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CYB561P49447 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CYB561P49447 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CYB561P49447 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CYB561P49447 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CYB561P49447 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CYB561P49447 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CYB561P49447 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CYB561P49447 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CYB561P49447 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CYB561P49447 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CYB561P49447 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CYB561P49447 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CYB561P49447 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CYB561P49447 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CYB561P49447 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CYB561P49447 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CYB561P49447 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CYB561P49447 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CYB561P49447 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CYB561P49447 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CYB561P49447 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CYB561P49447 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CYB561P49447 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CYB561P49447 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CYB561P49447 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CYB561P49447 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CYB561P49447 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CYB561P49447 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CYB561P49447 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CYB561P49447 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CYB561P49447 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CYB561P49447 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CYB561P49447 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CYB561P49447 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CYB561P49447 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CYB561P49447 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CYB561P49447 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CYB561P49447 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
CYB561P49447 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CYB561P49447 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CYB561P49447 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CYB561P49447 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CYB561P49447 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CYB561P49447 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CYB561P49447 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CYB561P49447 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CYB561P49447 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CYB561P49447 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CYB561P49447 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CYB561P49447 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CYB561P49447 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CYB561P49447 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CYB561P49447 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CYB561P49447 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CYB561P49447 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CYB561P49447 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CYB561P49447 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CYB561P49447 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CYB561P49447 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CYB561P49447 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CYB561P49447 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CYB561P49447 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CYB561P49447 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms