Protein–RNA interactions for Protein: P48507

GCLM, Glutamate--cysteine ligase regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLMP48507 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GCLMP48507 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GCLMP48507 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GCLMP48507 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GCLMP48507 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GCLMP48507 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GCLMP48507 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GCLMP48507 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GCLMP48507 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GCLMP48507 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GCLMP48507 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GCLMP48507 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GCLMP48507 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GCLMP48507 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GCLMP48507 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GCLMP48507 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
GCLMP48507 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GCLMP48507 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GCLMP48507 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GCLMP48507 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GCLMP48507 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GCLMP48507 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GCLMP48507 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GCLMP48507 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GCLMP48507 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GCLMP48507 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GCLMP48507 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GCLMP48507 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
GCLMP48507 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
GCLMP48507 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GCLMP48507 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
GCLMP48507 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GCLMP48507 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GCLMP48507 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GCLMP48507 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GCLMP48507 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
GCLMP48507 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GCLMP48507 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GCLMP48507 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GCLMP48507 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GCLMP48507 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GCLMP48507 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GCLMP48507 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GCLMP48507 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GCLMP48507 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GCLMP48507 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GCLMP48507 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GCLMP48507 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GCLMP48507 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GCLMP48507 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GCLMP48507 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GCLMP48507 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GCLMP48507 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GCLMP48507 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GCLMP48507 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GCLMP48507 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GCLMP48507 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GCLMP48507 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GCLMP48507 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GCLMP48507 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GCLMP48507 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GCLMP48507 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GCLMP48507 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GCLMP48507 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GCLMP48507 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GCLMP48507 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GCLMP48507 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GCLMP48507 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GCLMP48507 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GCLMP48507 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GCLMP48507 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GCLMP48507 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GCLMP48507 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GCLMP48507 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GCLMP48507 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GCLMP48507 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GCLMP48507 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
GCLMP48507 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GCLMP48507 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GCLMP48507 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GCLMP48507 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GCLMP48507 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GCLMP48507 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GCLMP48507 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GCLMP48507 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
GCLMP48507 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GCLMP48507 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GCLMP48507 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GCLMP48507 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GCLMP48507 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GCLMP48507 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GCLMP48507 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GCLMP48507 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GCLMP48507 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GCLMP48507 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GCLMP48507 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GCLMP48507 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GCLMP48507 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GCLMP48507 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
GCLMP48507 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms