Protein–RNA interactions for Protein: P48431

SOX2, Transcription factor SOX-2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX2P48431 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SOX2P48431 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SOX2P48431 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SOX2P48431 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SOX2P48431 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SOX2P48431 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SOX2P48431 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SOX2P48431 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SOX2P48431 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SOX2P48431 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SOX2P48431 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SOX2P48431 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SOX2P48431 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SOX2P48431 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SOX2P48431 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SOX2P48431 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SOX2P48431 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SOX2P48431 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SOX2P48431 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SOX2P48431 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SOX2P48431 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SOX2P48431 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SOX2P48431 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SOX2P48431 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SOX2P48431 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SOX2P48431 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SOX2P48431 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SOX2P48431 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SOX2P48431 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SOX2P48431 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SOX2P48431 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SOX2P48431 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SOX2P48431 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SOX2P48431 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SOX2P48431 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SOX2P48431 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SOX2P48431 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SOX2P48431 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SOX2P48431 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SOX2P48431 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SOX2P48431 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SOX2P48431 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SOX2P48431 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SOX2P48431 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SOX2P48431 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SOX2P48431 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SOX2P48431 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SOX2P48431 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SOX2P48431 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SOX2P48431 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SOX2P48431 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SOX2P48431 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SOX2P48431 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SOX2P48431 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SOX2P48431 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SOX2P48431 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SOX2P48431 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SOX2P48431 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SOX2P48431 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SOX2P48431 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SOX2P48431 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SOX2P48431 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SOX2P48431 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SOX2P48431 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SOX2P48431 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SOX2P48431 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SOX2P48431 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SOX2P48431 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SOX2P48431 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SOX2P48431 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SOX2P48431 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SOX2P48431 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SOX2P48431 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SOX2P48431 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SOX2P48431 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SOX2P48431 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SOX2P48431 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SOX2P48431 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SOX2P48431 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SOX2P48431 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SOX2P48431 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SOX2P48431 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SOX2P48431 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SOX2P48431 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SOX2P48431 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SOX2P48431 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SOX2P48431 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SOX2P48431 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SOX2P48431 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SOX2P48431 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SOX2P48431 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SOX2P48431 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SOX2P48431 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SOX2P48431 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SOX2P48431 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SOX2P48431 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SOX2P48431 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SOX2P48431 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SOX2P48431 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SOX2P48431 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms