Protein–RNA interactions for Protein: P47756

CAPZB, F-actin-capping protein subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPZBP47756 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPZBP47756 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPZBP47756 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPZBP47756 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPZBP47756 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPZBP47756 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPZBP47756 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPZBP47756 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPZBP47756 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPZBP47756 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPZBP47756 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CAPZBP47756 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CAPZBP47756 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CAPZBP47756 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAPZBP47756 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAPZBP47756 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAPZBP47756 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAPZBP47756 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAPZBP47756 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAPZBP47756 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAPZBP47756 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CAPZBP47756 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAPZBP47756 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAPZBP47756 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAPZBP47756 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAPZBP47756 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAPZBP47756 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAPZBP47756 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAPZBP47756 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAPZBP47756 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAPZBP47756 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAPZBP47756 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAPZBP47756 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAPZBP47756 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAPZBP47756 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPZBP47756 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPZBP47756 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPZBP47756 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPZBP47756 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPZBP47756 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPZBP47756 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPZBP47756 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPZBP47756 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPZBP47756 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPZBP47756 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPZBP47756 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPZBP47756 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPZBP47756 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPZBP47756 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPZBP47756 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPZBP47756 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPZBP47756 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPZBP47756 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPZBP47756 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPZBP47756 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPZBP47756 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPZBP47756 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPZBP47756 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPZBP47756 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPZBP47756 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPZBP47756 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPZBP47756 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPZBP47756 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPZBP47756 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPZBP47756 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPZBP47756 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPZBP47756 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPZBP47756 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPZBP47756 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAPZBP47756 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAPZBP47756 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAPZBP47756 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAPZBP47756 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAPZBP47756 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAPZBP47756 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAPZBP47756 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAPZBP47756 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CAPZBP47756 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CAPZBP47756 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CAPZBP47756 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CAPZBP47756 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CAPZBP47756 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CAPZBP47756 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPZBP47756 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPZBP47756 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPZBP47756 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPZBP47756 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPZBP47756 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPZBP47756 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPZBP47756 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPZBP47756 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPZBP47756 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPZBP47756 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPZBP47756 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPZBP47756 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPZBP47756 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPZBP47756 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPZBP47756 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPZBP47756 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPZBP47756 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms