Protein–RNA interactions for Protein: P46926

GNPDA1, Glucosamine-6-phosphate isomerase 1, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPDA1P46926 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GNPDA1P46926 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GNPDA1P46926 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GNPDA1P46926 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
GNPDA1P46926 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GNPDA1P46926 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GNPDA1P46926 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GNPDA1P46926 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GNPDA1P46926 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GNPDA1P46926 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GNPDA1P46926 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GNPDA1P46926 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GNPDA1P46926 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GNPDA1P46926 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GNPDA1P46926 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GNPDA1P46926 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GNPDA1P46926 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GNPDA1P46926 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GNPDA1P46926 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GNPDA1P46926 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GNPDA1P46926 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GNPDA1P46926 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GNPDA1P46926 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GNPDA1P46926 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GNPDA1P46926 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GNPDA1P46926 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GNPDA1P46926 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GNPDA1P46926 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GNPDA1P46926 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GNPDA1P46926 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GNPDA1P46926 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
GNPDA1P46926 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GNPDA1P46926 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GNPDA1P46926 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GNPDA1P46926 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GNPDA1P46926 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GNPDA1P46926 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GNPDA1P46926 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GNPDA1P46926 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GNPDA1P46926 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GNPDA1P46926 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GNPDA1P46926 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GNPDA1P46926 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GNPDA1P46926 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GNPDA1P46926 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GNPDA1P46926 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GNPDA1P46926 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GNPDA1P46926 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GNPDA1P46926 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GNPDA1P46926 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
GNPDA1P46926 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GNPDA1P46926 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GNPDA1P46926 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GNPDA1P46926 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GNPDA1P46926 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GNPDA1P46926 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GNPDA1P46926 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GNPDA1P46926 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GNPDA1P46926 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GNPDA1P46926 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GNPDA1P46926 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GNPDA1P46926 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GNPDA1P46926 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GNPDA1P46926 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GNPDA1P46926 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GNPDA1P46926 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GNPDA1P46926 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GNPDA1P46926 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GNPDA1P46926 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GNPDA1P46926 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GNPDA1P46926 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GNPDA1P46926 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GNPDA1P46926 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GNPDA1P46926 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GNPDA1P46926 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GNPDA1P46926 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GNPDA1P46926 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GNPDA1P46926 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GNPDA1P46926 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GNPDA1P46926 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GNPDA1P46926 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GNPDA1P46926 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GNPDA1P46926 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GNPDA1P46926 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GNPDA1P46926 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GNPDA1P46926 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GNPDA1P46926 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GNPDA1P46926 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GNPDA1P46926 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GNPDA1P46926 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GNPDA1P46926 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GNPDA1P46926 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GNPDA1P46926 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GNPDA1P46926 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GNPDA1P46926 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GNPDA1P46926 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GNPDA1P46926 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GNPDA1P46926 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GNPDA1P46926 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GNPDA1P46926 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms