Protein–RNA interactions for Protein: P46094

XCR1, Chemokine XC receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCR1P46094 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
XCR1P46094 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
XCR1P46094 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
XCR1P46094 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
XCR1P46094 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
XCR1P46094 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
XCR1P46094 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
XCR1P46094 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
XCR1P46094 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
XCR1P46094 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
XCR1P46094 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
XCR1P46094 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
XCR1P46094 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
XCR1P46094 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
XCR1P46094 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
XCR1P46094 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
XCR1P46094 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
XCR1P46094 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
XCR1P46094 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
XCR1P46094 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
XCR1P46094 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
XCR1P46094 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
XCR1P46094 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
XCR1P46094 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
XCR1P46094 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
XCR1P46094 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
XCR1P46094 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
XCR1P46094 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
XCR1P46094 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
XCR1P46094 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
XCR1P46094 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
XCR1P46094 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
XCR1P46094 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
XCR1P46094 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
XCR1P46094 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
XCR1P46094 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
XCR1P46094 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
XCR1P46094 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
XCR1P46094 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
XCR1P46094 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
XCR1P46094 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
XCR1P46094 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
XCR1P46094 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
XCR1P46094 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
XCR1P46094 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
XCR1P46094 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
XCR1P46094 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
XCR1P46094 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
XCR1P46094 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
XCR1P46094 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
XCR1P46094 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
XCR1P46094 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
XCR1P46094 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
XCR1P46094 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
XCR1P46094 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
XCR1P46094 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
XCR1P46094 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
XCR1P46094 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
XCR1P46094 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
XCR1P46094 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
XCR1P46094 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
XCR1P46094 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
XCR1P46094 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
XCR1P46094 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
XCR1P46094 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
XCR1P46094 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
XCR1P46094 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
XCR1P46094 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
XCR1P46094 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
XCR1P46094 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
XCR1P46094 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
XCR1P46094 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
XCR1P46094 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
XCR1P46094 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
XCR1P46094 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
XCR1P46094 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
XCR1P46094 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
XCR1P46094 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
XCR1P46094 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
XCR1P46094 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
XCR1P46094 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
XCR1P46094 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
XCR1P46094 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
XCR1P46094 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
XCR1P46094 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
XCR1P46094 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
XCR1P46094 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
XCR1P46094 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
XCR1P46094 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
XCR1P46094 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
XCR1P46094 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
XCR1P46094 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
XCR1P46094 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
XCR1P46094 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
XCR1P46094 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
XCR1P46094 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
XCR1P46094 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
XCR1P46094 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
XCR1P46094 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
XCR1P46094 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms