Protein–RNA interactions for Protein: P43354

NR4A2, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 2, humanhuman

Predictions only

Length 598 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR4A2P43354 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NR4A2P43354 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NR4A2P43354 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NR4A2P43354 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NR4A2P43354 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NR4A2P43354 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
NR4A2P43354 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NR4A2P43354 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NR4A2P43354 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NR4A2P43354 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NR4A2P43354 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
NR4A2P43354 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NR4A2P43354 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
NR4A2P43354 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NR4A2P43354 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NR4A2P43354 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
NR4A2P43354 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NR4A2P43354 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NR4A2P43354 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NR4A2P43354 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NR4A2P43354 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NR4A2P43354 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NR4A2P43354 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NR4A2P43354 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
NR4A2P43354 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NR4A2P43354 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NR4A2P43354 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NR4A2P43354 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NR4A2P43354 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NR4A2P43354 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NR4A2P43354 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NR4A2P43354 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NR4A2P43354 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NR4A2P43354 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
NR4A2P43354 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NR4A2P43354 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
NR4A2P43354 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NR4A2P43354 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NR4A2P43354 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NR4A2P43354 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NR4A2P43354 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NR4A2P43354 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NR4A2P43354 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
NR4A2P43354 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NR4A2P43354 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NR4A2P43354 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NR4A2P43354 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NR4A2P43354 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NR4A2P43354 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NR4A2P43354 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NR4A2P43354 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NR4A2P43354 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NR4A2P43354 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NR4A2P43354 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NR4A2P43354 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NR4A2P43354 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NR4A2P43354 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NR4A2P43354 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NR4A2P43354 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NR4A2P43354 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NR4A2P43354 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NR4A2P43354 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NR4A2P43354 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
NR4A2P43354 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NR4A2P43354 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NR4A2P43354 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NR4A2P43354 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NR4A2P43354 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NR4A2P43354 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NR4A2P43354 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NR4A2P43354 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NR4A2P43354 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NR4A2P43354 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NR4A2P43354 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
NR4A2P43354 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NR4A2P43354 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NR4A2P43354 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NR4A2P43354 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NR4A2P43354 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NR4A2P43354 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NR4A2P43354 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NR4A2P43354 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NR4A2P43354 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NR4A2P43354 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NR4A2P43354 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NR4A2P43354 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NR4A2P43354 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NR4A2P43354 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NR4A2P43354 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NR4A2P43354 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NR4A2P43354 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NR4A2P43354 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NR4A2P43354 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NR4A2P43354 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NR4A2P43354 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NR4A2P43354 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NR4A2P43354 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NR4A2P43354 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
NR4A2P43354 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
NR4A2P43354 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms