Protein–RNA interactions for Protein: P43268

ETV4, ETS translocation variant 4, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV4P43268 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ETV4P43268 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ETV4P43268 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ETV4P43268 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ETV4P43268 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ETV4P43268 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ETV4P43268 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ETV4P43268 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ETV4P43268 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ETV4P43268 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ETV4P43268 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ETV4P43268 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ETV4P43268 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ETV4P43268 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ETV4P43268 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ETV4P43268 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ETV4P43268 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ETV4P43268 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ETV4P43268 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ETV4P43268 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ETV4P43268 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ETV4P43268 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ETV4P43268 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ETV4P43268 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ETV4P43268 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ETV4P43268 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ETV4P43268 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ETV4P43268 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ETV4P43268 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ETV4P43268 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ETV4P43268 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ETV4P43268 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ETV4P43268 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ETV4P43268 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ETV4P43268 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ETV4P43268 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ETV4P43268 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ETV4P43268 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ETV4P43268 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ETV4P43268 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ETV4P43268 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ETV4P43268 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ETV4P43268 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ETV4P43268 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ETV4P43268 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ETV4P43268 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ETV4P43268 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ETV4P43268 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ETV4P43268 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ETV4P43268 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ETV4P43268 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ETV4P43268 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ETV4P43268 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ETV4P43268 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ETV4P43268 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ETV4P43268 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ETV4P43268 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ETV4P43268 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ETV4P43268 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ETV4P43268 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ETV4P43268 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ETV4P43268 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ETV4P43268 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ETV4P43268 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ETV4P43268 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ETV4P43268 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ETV4P43268 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ETV4P43268 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ETV4P43268 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ETV4P43268 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ETV4P43268 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ETV4P43268 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ETV4P43268 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ETV4P43268 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ETV4P43268 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ETV4P43268 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ETV4P43268 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ETV4P43268 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ETV4P43268 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ETV4P43268 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ETV4P43268 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ETV4P43268 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ETV4P43268 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ETV4P43268 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ETV4P43268 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ETV4P43268 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ETV4P43268 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ETV4P43268 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ETV4P43268 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ETV4P43268 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ETV4P43268 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ETV4P43268 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ETV4P43268 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ETV4P43268 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ETV4P43268 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ETV4P43268 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ETV4P43268 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ETV4P43268 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ETV4P43268 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ETV4P43268 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms