Protein–RNA interactions for Protein: P36956

SREBF1, Sterol regulatory element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF1P36956 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SREBF1P36956 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SREBF1P36956 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SREBF1P36956 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SREBF1P36956 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SREBF1P36956 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SREBF1P36956 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SREBF1P36956 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SREBF1P36956 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SREBF1P36956 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SREBF1P36956 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SREBF1P36956 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SREBF1P36956 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SREBF1P36956 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SREBF1P36956 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SREBF1P36956 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SREBF1P36956 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SREBF1P36956 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SREBF1P36956 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SREBF1P36956 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SREBF1P36956 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SREBF1P36956 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SREBF1P36956 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SREBF1P36956 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SREBF1P36956 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SREBF1P36956 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SREBF1P36956 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SREBF1P36956 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SREBF1P36956 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SREBF1P36956 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SREBF1P36956 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SREBF1P36956 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SREBF1P36956 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SREBF1P36956 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SREBF1P36956 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SREBF1P36956 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SREBF1P36956 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SREBF1P36956 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SREBF1P36956 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SREBF1P36956 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
SREBF1P36956 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SREBF1P36956 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SREBF1P36956 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SREBF1P36956 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SREBF1P36956 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SREBF1P36956 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SREBF1P36956 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SREBF1P36956 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SREBF1P36956 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SREBF1P36956 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SREBF1P36956 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SREBF1P36956 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SREBF1P36956 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SREBF1P36956 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SREBF1P36956 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SREBF1P36956 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SREBF1P36956 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SREBF1P36956 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SREBF1P36956 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SREBF1P36956 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SREBF1P36956 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SREBF1P36956 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SREBF1P36956 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SREBF1P36956 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SREBF1P36956 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SREBF1P36956 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SREBF1P36956 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SREBF1P36956 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SREBF1P36956 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SREBF1P36956 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
SREBF1P36956 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SREBF1P36956 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SREBF1P36956 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SREBF1P36956 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SREBF1P36956 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SREBF1P36956 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SREBF1P36956 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SREBF1P36956 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SREBF1P36956 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SREBF1P36956 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SREBF1P36956 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SREBF1P36956 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SREBF1P36956 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SREBF1P36956 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SREBF1P36956 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SREBF1P36956 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SREBF1P36956 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SREBF1P36956 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SREBF1P36956 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SREBF1P36956 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SREBF1P36956 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SREBF1P36956 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SREBF1P36956 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SREBF1P36956 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
SREBF1P36956 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SREBF1P36956 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SREBF1P36956 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SREBF1P36956 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SREBF1P36956 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SREBF1P36956 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms