Protein–RNA interactions for Protein: P36897

TGFBR1, TGF-beta receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR1P36897 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TGFBR1P36897 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TGFBR1P36897 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TGFBR1P36897 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TGFBR1P36897 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TGFBR1P36897 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TGFBR1P36897 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TGFBR1P36897 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TGFBR1P36897 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TGFBR1P36897 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TGFBR1P36897 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TGFBR1P36897 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TGFBR1P36897 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TGFBR1P36897 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TGFBR1P36897 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TGFBR1P36897 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TGFBR1P36897 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TGFBR1P36897 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TGFBR1P36897 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TGFBR1P36897 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TGFBR1P36897 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TGFBR1P36897 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TGFBR1P36897 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TGFBR1P36897 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TGFBR1P36897 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TGFBR1P36897 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TGFBR1P36897 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TGFBR1P36897 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TGFBR1P36897 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TGFBR1P36897 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TGFBR1P36897 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TGFBR1P36897 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TGFBR1P36897 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TGFBR1P36897 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TGFBR1P36897 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TGFBR1P36897 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TGFBR1P36897 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TGFBR1P36897 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TGFBR1P36897 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TGFBR1P36897 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
TGFBR1P36897 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TGFBR1P36897 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TGFBR1P36897 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TGFBR1P36897 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TGFBR1P36897 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TGFBR1P36897 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TGFBR1P36897 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TGFBR1P36897 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TGFBR1P36897 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TGFBR1P36897 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TGFBR1P36897 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TGFBR1P36897 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TGFBR1P36897 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TGFBR1P36897 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TGFBR1P36897 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TGFBR1P36897 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TGFBR1P36897 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TGFBR1P36897 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TGFBR1P36897 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TGFBR1P36897 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TGFBR1P36897 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TGFBR1P36897 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TGFBR1P36897 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TGFBR1P36897 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TGFBR1P36897 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TGFBR1P36897 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TGFBR1P36897 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TGFBR1P36897 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TGFBR1P36897 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TGFBR1P36897 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TGFBR1P36897 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TGFBR1P36897 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TGFBR1P36897 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TGFBR1P36897 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TGFBR1P36897 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TGFBR1P36897 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TGFBR1P36897 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TGFBR1P36897 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
TGFBR1P36897 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TGFBR1P36897 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TGFBR1P36897 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TGFBR1P36897 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TGFBR1P36897 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TGFBR1P36897 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TGFBR1P36897 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TGFBR1P36897 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TGFBR1P36897 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TGFBR1P36897 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
TGFBR1P36897 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
TGFBR1P36897 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TGFBR1P36897 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TGFBR1P36897 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
TGFBR1P36897 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TGFBR1P36897 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TGFBR1P36897 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TGFBR1P36897 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TGFBR1P36897 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TGFBR1P36897 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TGFBR1P36897 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TGFBR1P36897 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms