Protein–RNA interactions for Protein: P35663

CYLC1, Cylicin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYLC1P35663 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CYLC1P35663 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CYLC1P35663 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CYLC1P35663 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CYLC1P35663 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CYLC1P35663 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CYLC1P35663 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CYLC1P35663 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CYLC1P35663 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CYLC1P35663 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CYLC1P35663 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CYLC1P35663 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CYLC1P35663 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CYLC1P35663 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CYLC1P35663 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CYLC1P35663 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CYLC1P35663 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CYLC1P35663 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CYLC1P35663 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CYLC1P35663 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CYLC1P35663 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CYLC1P35663 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CYLC1P35663 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CYLC1P35663 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CYLC1P35663 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CYLC1P35663 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CYLC1P35663 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CYLC1P35663 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CYLC1P35663 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CYLC1P35663 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CYLC1P35663 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CYLC1P35663 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CYLC1P35663 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CYLC1P35663 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CYLC1P35663 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CYLC1P35663 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CYLC1P35663 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CYLC1P35663 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CYLC1P35663 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CYLC1P35663 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CYLC1P35663 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CYLC1P35663 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CYLC1P35663 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CYLC1P35663 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CYLC1P35663 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CYLC1P35663 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CYLC1P35663 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CYLC1P35663 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CYLC1P35663 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CYLC1P35663 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CYLC1P35663 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CYLC1P35663 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CYLC1P35663 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CYLC1P35663 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CYLC1P35663 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CYLC1P35663 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CYLC1P35663 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CYLC1P35663 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CYLC1P35663 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CYLC1P35663 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CYLC1P35663 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CYLC1P35663 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CYLC1P35663 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CYLC1P35663 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CYLC1P35663 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CYLC1P35663 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CYLC1P35663 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CYLC1P35663 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CYLC1P35663 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CYLC1P35663 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CYLC1P35663 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CYLC1P35663 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CYLC1P35663 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CYLC1P35663 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CYLC1P35663 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CYLC1P35663 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CYLC1P35663 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CYLC1P35663 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CYLC1P35663 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CYLC1P35663 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CYLC1P35663 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CYLC1P35663 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CYLC1P35663 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CYLC1P35663 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CYLC1P35663 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CYLC1P35663 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CYLC1P35663 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CYLC1P35663 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CYLC1P35663 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CYLC1P35663 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CYLC1P35663 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CYLC1P35663 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CYLC1P35663 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CYLC1P35663 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CYLC1P35663 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CYLC1P35663 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CYLC1P35663 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CYLC1P35663 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CYLC1P35663 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CYLC1P35663 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms