Protein–RNA interactions for Protein: P35638

DDIT3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDIT3P35638 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
DDIT3P35638 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
DDIT3P35638 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
DDIT3P35638 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
DDIT3P35638 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
DDIT3P35638 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
DDIT3P35638 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
DDIT3P35638 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
DDIT3P35638 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
DDIT3P35638 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
DDIT3P35638 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
DDIT3P35638 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
DDIT3P35638 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
DDIT3P35638 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
DDIT3P35638 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
DDIT3P35638 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
DDIT3P35638 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
DDIT3P35638 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
DDIT3P35638 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
DDIT3P35638 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
DDIT3P35638 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
DDIT3P35638 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
DDIT3P35638 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
DDIT3P35638 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
DDIT3P35638 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
DDIT3P35638 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
DDIT3P35638 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
DDIT3P35638 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
DDIT3P35638 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
DDIT3P35638 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
DDIT3P35638 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
DDIT3P35638 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
DDIT3P35638 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
DDIT3P35638 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
DDIT3P35638 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
DDIT3P35638 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
DDIT3P35638 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
DDIT3P35638 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
DDIT3P35638 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
DDIT3P35638 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
DDIT3P35638 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
DDIT3P35638 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
DDIT3P35638 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
DDIT3P35638 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
DDIT3P35638 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
DDIT3P35638 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
DDIT3P35638 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
DDIT3P35638 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
DDIT3P35638 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
DDIT3P35638 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
DDIT3P35638 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
DDIT3P35638 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
DDIT3P35638 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
DDIT3P35638 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
DDIT3P35638 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
DDIT3P35638 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
DDIT3P35638 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
DDIT3P35638 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
DDIT3P35638 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
DDIT3P35638 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
DDIT3P35638 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
DDIT3P35638 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
DDIT3P35638 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
DDIT3P35638 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
DDIT3P35638 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
DDIT3P35638 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
DDIT3P35638 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
DDIT3P35638 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
DDIT3P35638 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
DDIT3P35638 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
DDIT3P35638 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
DDIT3P35638 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
DDIT3P35638 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
DDIT3P35638 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
DDIT3P35638 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
DDIT3P35638 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
DDIT3P35638 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
DDIT3P35638 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
DDIT3P35638 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
DDIT3P35638 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
DDIT3P35638 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
DDIT3P35638 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
DDIT3P35638 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
DDIT3P35638 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
DDIT3P35638 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
DDIT3P35638 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
DDIT3P35638 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
DDIT3P35638 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
DDIT3P35638 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
DDIT3P35638 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
DDIT3P35638 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
DDIT3P35638 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
DDIT3P35638 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
DDIT3P35638 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
DDIT3P35638 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
DDIT3P35638 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
DDIT3P35638 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
DDIT3P35638 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
DDIT3P35638 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
DDIT3P35638 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms