Protein–RNA interactions for Protein: P35523

CLCN1, Chloride channel protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 988 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCN1P35523 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CLCN1P35523 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CLCN1P35523 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CLCN1P35523 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CLCN1P35523 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CLCN1P35523 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CLCN1P35523 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CLCN1P35523 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CLCN1P35523 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CLCN1P35523 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CLCN1P35523 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CLCN1P35523 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CLCN1P35523 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CLCN1P35523 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CLCN1P35523 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CLCN1P35523 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CLCN1P35523 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CLCN1P35523 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CLCN1P35523 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CLCN1P35523 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CLCN1P35523 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CLCN1P35523 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CLCN1P35523 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CLCN1P35523 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CLCN1P35523 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CLCN1P35523 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CLCN1P35523 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CLCN1P35523 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CLCN1P35523 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CLCN1P35523 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CLCN1P35523 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CLCN1P35523 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CLCN1P35523 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CLCN1P35523 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CLCN1P35523 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CLCN1P35523 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CLCN1P35523 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CLCN1P35523 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CLCN1P35523 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CLCN1P35523 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CLCN1P35523 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CLCN1P35523 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CLCN1P35523 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CLCN1P35523 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CLCN1P35523 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CLCN1P35523 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
CLCN1P35523 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC26.01■■□□□ 1.76
CLCN1P35523 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CLCN1P35523 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CLCN1P35523 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CLCN1P35523 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CLCN1P35523 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CLCN1P35523 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CLCN1P35523 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
CLCN1P35523 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CLCN1P35523 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CLCN1P35523 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
CLCN1P35523 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CLCN1P35523 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CLCN1P35523 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CLCN1P35523 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CLCN1P35523 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CLCN1P35523 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CLCN1P35523 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CLCN1P35523 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CLCN1P35523 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CLCN1P35523 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CLCN1P35523 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CLCN1P35523 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CLCN1P35523 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CLCN1P35523 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CLCN1P35523 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CLCN1P35523 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CLCN1P35523 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CLCN1P35523 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CLCN1P35523 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CLCN1P35523 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CLCN1P35523 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CLCN1P35523 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CLCN1P35523 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CLCN1P35523 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CLCN1P35523 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CLCN1P35523 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CLCN1P35523 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CLCN1P35523 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CLCN1P35523 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CLCN1P35523 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CLCN1P35523 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CLCN1P35523 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CLCN1P35523 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CLCN1P35523 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CLCN1P35523 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CLCN1P35523 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CLCN1P35523 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CLCN1P35523 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CLCN1P35523 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CLCN1P35523 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CLCN1P35523 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CLCN1P35523 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
CLCN1P35523 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms