Protein–RNA interactions for Protein: P35227

PCGF2, Polycomb group RING finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF2P35227 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCGF2P35227 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
PCGF2P35227 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCGF2P35227 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCGF2P35227 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCGF2P35227 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCGF2P35227 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCGF2P35227 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCGF2P35227 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCGF2P35227 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCGF2P35227 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PCGF2P35227 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCGF2P35227 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PCGF2P35227 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCGF2P35227 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCGF2P35227 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCGF2P35227 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCGF2P35227 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCGF2P35227 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCGF2P35227 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCGF2P35227 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCGF2P35227 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCGF2P35227 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCGF2P35227 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCGF2P35227 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCGF2P35227 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCGF2P35227 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCGF2P35227 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCGF2P35227 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCGF2P35227 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCGF2P35227 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCGF2P35227 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCGF2P35227 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCGF2P35227 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCGF2P35227 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCGF2P35227 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCGF2P35227 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCGF2P35227 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCGF2P35227 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCGF2P35227 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCGF2P35227 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCGF2P35227 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCGF2P35227 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCGF2P35227 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCGF2P35227 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCGF2P35227 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCGF2P35227 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCGF2P35227 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCGF2P35227 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCGF2P35227 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCGF2P35227 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCGF2P35227 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCGF2P35227 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCGF2P35227 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCGF2P35227 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCGF2P35227 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCGF2P35227 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCGF2P35227 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCGF2P35227 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PCGF2P35227 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCGF2P35227 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCGF2P35227 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCGF2P35227 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCGF2P35227 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCGF2P35227 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCGF2P35227 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCGF2P35227 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCGF2P35227 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PCGF2P35227 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCGF2P35227 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCGF2P35227 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCGF2P35227 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCGF2P35227 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PCGF2P35227 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCGF2P35227 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCGF2P35227 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCGF2P35227 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCGF2P35227 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCGF2P35227 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PCGF2P35227 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PCGF2P35227 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PCGF2P35227 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PCGF2P35227 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PCGF2P35227 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PCGF2P35227 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PCGF2P35227 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PCGF2P35227 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PCGF2P35227 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PCGF2P35227 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PCGF2P35227 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PCGF2P35227 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PCGF2P35227 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PCGF2P35227 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PCGF2P35227 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PCGF2P35227 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PCGF2P35227 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PCGF2P35227 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PCGF2P35227 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PCGF2P35227 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCGF2P35227 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms