Protein–RNA interactions for Protein: P35221

CTNNA1, Catenin alpha-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA1P35221 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTNNA1P35221 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CTNNA1P35221 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTNNA1P35221 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTNNA1P35221 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTNNA1P35221 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTNNA1P35221 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTNNA1P35221 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTNNA1P35221 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTNNA1P35221 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CTNNA1P35221 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTNNA1P35221 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTNNA1P35221 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTNNA1P35221 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTNNA1P35221 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTNNA1P35221 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTNNA1P35221 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTNNA1P35221 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTNNA1P35221 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTNNA1P35221 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTNNA1P35221 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTNNA1P35221 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTNNA1P35221 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTNNA1P35221 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CTNNA1P35221 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CTNNA1P35221 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTNNA1P35221 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTNNA1P35221 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTNNA1P35221 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTNNA1P35221 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTNNA1P35221 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTNNA1P35221 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTNNA1P35221 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTNNA1P35221 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTNNA1P35221 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTNNA1P35221 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTNNA1P35221 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTNNA1P35221 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTNNA1P35221 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTNNA1P35221 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTNNA1P35221 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CTNNA1P35221 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTNNA1P35221 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTNNA1P35221 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTNNA1P35221 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTNNA1P35221 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTNNA1P35221 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTNNA1P35221 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CTNNA1P35221 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CTNNA1P35221 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CTNNA1P35221 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CTNNA1P35221 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CTNNA1P35221 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CTNNA1P35221 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CTNNA1P35221 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CTNNA1P35221 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CTNNA1P35221 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTNNA1P35221 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTNNA1P35221 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTNNA1P35221 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CTNNA1P35221 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTNNA1P35221 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTNNA1P35221 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTNNA1P35221 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTNNA1P35221 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTNNA1P35221 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTNNA1P35221 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CTNNA1P35221 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTNNA1P35221 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTNNA1P35221 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTNNA1P35221 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTNNA1P35221 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTNNA1P35221 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTNNA1P35221 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CTNNA1P35221 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTNNA1P35221 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTNNA1P35221 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTNNA1P35221 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTNNA1P35221 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTNNA1P35221 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTNNA1P35221 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTNNA1P35221 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTNNA1P35221 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTNNA1P35221 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CTNNA1P35221 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTNNA1P35221 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTNNA1P35221 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTNNA1P35221 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTNNA1P35221 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTNNA1P35221 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTNNA1P35221 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTNNA1P35221 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTNNA1P35221 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTNNA1P35221 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CTNNA1P35221 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTNNA1P35221 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTNNA1P35221 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTNNA1P35221 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTNNA1P35221 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTNNA1P35221 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms