Protein–RNA interactions for Protein: P32842

VMA11, V-type proton ATPase subunit c', yeast

Predictions only

Length 164 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VMA11	P32842	HPF1	YOL155C	2904 nt		4.11	□□□□□ -1.75
VMA11	P32842	FUM1	YPL262W	1467 nt		4.11	□□□□□ -1.75
VMA11	P32842	DRN1	YGR093W	1524 nt		4.11	□□□□□ -1.75
VMA11	P32842	YGR125W	YGR125W	3111 nt		4.11	□□□□□ -1.75
VMA11	P32842	FAA3	YIL009W	2085 nt		4.11	□□□□□ -1.75
VMA11	P32842	SEG2	YKL105C	3399 nt		4.11	□□□□□ -1.75
VMA11	P32842	GCS1	YDL226C	1059 nt		4.11	□□□□□ -1.75
VMA11	P32842	SNF11	YDR073W	510 nt		4.11	□□□□□ -1.75
VMA11	P32842	ADK2	YER170W	678 nt		4.11	□□□□□ -1.75
VMA11	P32842	PUS6	YGR169C	1215 nt		4.11	□□□□□ -1.75
VMA11	P32842	CAB4	YGR277C	918 nt		4.11	□□□□□ -1.75
VMA11	P32842	ECM2	YBR065C	1095 nt		4.11	□□□□□ -1.75
VMA11	P32842	CPS1	YJL172W	1731 nt		4.11	□□□□□ -1.75
VMA11	P32842	BRF1	YGR246C	1791 nt		4.11	□□□□□ -1.75
VMA11	P32842	YLH47	YPR125W	1365 nt		4.11	□□□□□ -1.75
VMA11	P32842	UBP9	YER098W	2265 nt		4.1	□□□□□ -1.75
VMA11	P32842	URA7	YBL039C	1740 nt		4.1	□□□□□ -1.75
VMA11	P32842	MF(ALPHA)2	YGL089C	363 nt		4.1	□□□□□ -1.75
VMA11	P32842	YOR024W	YOR024W	324 nt		4.1	□□□□□ -1.75
VMA11	P32842	FEX1	YOR390W	1128 nt		4.1	□□□□□ -1.75
VMA11	P32842	FEX2	YPL279C	1128 nt		4.1	□□□□□ -1.75
VMA11	P32842	NUP1	YOR098C	3231 nt		4.1	□□□□□ -1.75
VMA11	P32842	GDB1	YPR184W	4611 nt		4.1	□□□□□ -1.75
VMA11	P32842	FOL1	YNL256W	2475 nt		4.1	□□□□□ -1.75
VMA11	P32842	SSY5	YJL156C	2100 nt		4.09	□□□□□ -1.75
VMA11	P32842	ERD1	YDR414C	1089 nt		4.09	□□□□□ -1.75
VMA11	P32842	FAU1	YER183C	636 nt		4.09	□□□□□ -1.75
VMA11	P32842	YGR035W-A	YGR035W-A	222 nt		4.09	□□□□□ -1.75
VMA11	P32842	NIT2	YJL126W	924 nt		4.09	□□□□□ -1.75
VMA11	P32842	SFK1	YKL051W	1062 nt		4.09	□□□□□ -1.75
VMA11	P32842	GAT3	YLR013W	426 nt		4.09	□□□□□ -1.75
VMA11	P32842	MIM2	YLR099W-A	264 nt		4.09	□□□□□ -1.75
VMA11	P32842	SYG1	YIL047C	2709 nt		4.09	□□□□□ -1.75
VMA11	P32842	THP1	YOL072W	1368 nt		4.09	□□□□□ -1.75
VMA11	P32842	NSG1	YHR133C	876 nt		4.08	□□□□□ -1.76
VMA11	P32842	SER33	YIL074C	1410 nt		4.08	□□□□□ -1.76
VMA11	P32842	VHS2	YIL135C	1311 nt		4.08	□□□□□ -1.76
VMA11	P32842	YMR105W-A	YMR105W-A	195 nt		4.08	□□□□□ -1.76
VMA11	P32842	ATH1	YPR026W	3636 nt		4.08	□□□□□ -1.76
VMA11	P32842	PZF1	YPR186C	1290 nt		4.08	□□□□□ -1.76
VMA11	P32842	RAD16	YBR114W	2373 nt		4.08	□□□□□ -1.76
VMA11	P32842	PDI1	YCL043C	1569 nt		4.08	□□□□□ -1.76
VMA11	P32842	NOT3	YIL038C	2511 nt		4.07	□□□□□ -1.76
VMA11	P32842	PCA1	YBR295W	3651 nt		4.07	□□□□□ -1.76
VMA11	P32842	ADE4	YMR300C	1533 nt		4.07	□□□□□ -1.76
VMA11	P32842	HAP1	YLR256W	4509 nt		4.07	□□□□□ -1.76
VMA11	P32842	IWR1	YDL115C	1062 nt		4.07	□□□□□ -1.76
VMA11	P32842	SPT3	YDR392W	1014 nt		4.07	□□□□□ -1.76
VMA11	P32842	PAD1	YDR538W	729 nt		4.07	□□□□□ -1.76
VMA11	P32842	SWP1	YMR149W	861 nt		4.07	□□□□□ -1.76
VMA11	P32842	HOF1	YMR032W	2010 nt		4.07	□□□□□ -1.76
VMA11	P32842	SCM3	YDL139C	672 nt		4.06	□□□□□ -1.76
VMA11	P32842	NQM1	YGR043C	1002 nt		4.06	□□□□□ -1.76
VMA11	P32842	YHR212W-A	YHR212W-A	204 nt		4.06	□□□□□ -1.76
VMA11	P32842	KTI12	YKL110C	942 nt		4.06	□□□□□ -1.76
VMA11	P32842	YAR061W	YAR061W	204 nt		4.06	□□□□□ -1.76
VMA11	P32842	YLR346C	YLR346C	306 nt		4.06	□□□□□ -1.76
VMA11	P32842	RDL1	YOR285W	420 nt		4.06	□□□□□ -1.76
VMA11	P32842	MGR2	YPL098C	342 nt		4.06	□□□□□ -1.76
VMA11	P32842	MPP10	YJR002W	1782 nt		4.06	□□□□□ -1.76
VMA11	P32842	DBF2	YGR092W	1719 nt		4.06	□□□□□ -1.76
VMA11	P32842	CLF1	YLR117C	2064 nt		4.06	□□□□□ -1.76
VMA11	P32842	TDA7	YNL176C	1911 nt		4.05	□□□□□ -1.76
VMA11	P32842	ARN1	YHL040C	1884 nt		4.05	□□□□□ -1.76
VMA11	P32842	YNG2	YHR090C	849 nt		4.05	□□□□□ -1.76
VMA11	P32842	FUN19	YAL034C	1242 nt		4.05	□□□□□ -1.76
VMA11	P32842	DOA1	YKL213C	2148 nt		4.05	□□□□□ -1.76
VMA11	P32842	YMR030W-A	YMR030W-A	291 nt		4.05	□□□□□ -1.76
VMA11	P32842	SSZ1	YHR064C	1617 nt		4.05	□□□□□ -1.76
VMA11	P32842	APL6	YGR261C	2430 nt		4.05	□□□□□ -1.76
VMA11	P32842	APE1	YKL103C	1545 nt		4.05	□□□□□ -1.76
VMA11	P32842	APM4	YOL062C	1476 nt		4.05	□□□□□ -1.76
VMA11	P32842	GIP2	YER054C	1647 nt		4.04	□□□□□ -1.76
VMA11	P32842	ASP1	YDR321W	1146 nt		4.04	□□□□□ -1.76
VMA11	P32842	SKI6	YGR195W	741 nt		4.04	□□□□□ -1.76
VMA11	P32842	SPL2	YHR136C	447 nt		4.04	□□□□□ -1.76
VMA11	P32842	YAL044W-A	YAL044W-A	333 nt		4.04	□□□□□ -1.76
VMA11	P32842	SOL1	YNR034W	966 nt		4.04	□□□□□ -1.76
VMA11	P32842	RPL3	YOR063W	1164 nt		4.04	□□□□□ -1.76
VMA11	P32842	LAS21	YJL062W	2493 nt		4.04	□□□□□ -1.76
VMA11	P32842	ATG18	YFR021W	1503 nt		4.04	□□□□□ -1.76
VMA11	P32842	STP4	YDL048C	1473 nt		4.04	□□□□□ -1.76
VMA11	P32842	YOR1	YGR281W	4434 nt		4.04	□□□□□ -1.76
VMA11	P32842	DPB2	YPR175W	2070 nt		4.03	□□□□□ -1.76
VMA11	P32842	FHL1	YPR104C	2811 nt		4.03	□□□□□ -1.76
VMA11	P32842	RSM10	YDR041W	612 nt		4.03	□□□□□ -1.76
VMA11	P32842	YER187W	YER187W	426 nt		4.03	□□□□□ -1.76
VMA11	P32842	YHR095W	YHR095W	495 nt		4.03	□□□□□ -1.76
VMA11	P32842	YKR041W	YKR041W	753 nt		4.03	□□□□□ -1.76
VMA11	P32842	RCL1	YOL010W	1104 nt		4.03	□□□□□ -1.76
VMA11	P32842	TGS1	YPL157W	948 nt		4.03	□□□□□ -1.76
VMA11	P32842	YEF1	YEL041W	1488 nt		4.03	□□□□□ -1.76
VMA11	P32842	YDR261C-D	YDR261C-D	4815 nt		4.03	□□□□□ -1.76
VMA11	P32842	PRR1	YKL116C	1557 nt		4.02	□□□□□ -1.77
VMA11	P32842	PSY4	YBL046W	1326 nt		4.02	□□□□□ -1.77
VMA11	P32842	HXT4	YHR092C	1731 nt		4.02	□□□□□ -1.77
VMA11	P32842	NPY1	YGL067W	1155 nt		4.02	□□□□□ -1.77
VMA11	P32842	SCW10	YMR305C	1170 nt		4.02	□□□□□ -1.77
VMA11	P32842	APM2	YHL019C	1818 nt		4.02	□□□□□ -1.77
VMA11	P32842	MOT2	YER068W	1764 nt		4.02	□□□□□ -1.77

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