Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CASQ1P31415 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CASQ1P31415 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CASQ1P31415 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CASQ1P31415 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CASQ1P31415 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CASQ1P31415 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CASQ1P31415 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CASQ1P31415 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CASQ1P31415 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CASQ1P31415 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CASQ1P31415 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CASQ1P31415 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CASQ1P31415 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CASQ1P31415 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CASQ1P31415 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CASQ1P31415 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CASQ1P31415 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CASQ1P31415 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CASQ1P31415 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CASQ1P31415 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CASQ1P31415 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CASQ1P31415 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CASQ1P31415 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CASQ1P31415 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CASQ1P31415 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CASQ1P31415 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CASQ1P31415 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CASQ1P31415 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CASQ1P31415 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CASQ1P31415 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CASQ1P31415 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CASQ1P31415 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CASQ1P31415 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CASQ1P31415 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CASQ1P31415 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CASQ1P31415 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CASQ1P31415 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CASQ1P31415 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CASQ1P31415 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CASQ1P31415 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CASQ1P31415 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CASQ1P31415 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CASQ1P31415 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CASQ1P31415 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CASQ1P31415 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CASQ1P31415 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CASQ1P31415 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CASQ1P31415 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CASQ1P31415 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CASQ1P31415 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CASQ1P31415 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CASQ1P31415 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CASQ1P31415 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CASQ1P31415 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CASQ1P31415 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CASQ1P31415 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CASQ1P31415 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CASQ1P31415 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CASQ1P31415 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CASQ1P31415 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CASQ1P31415 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CASQ1P31415 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CASQ1P31415 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CASQ1P31415 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CASQ1P31415 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CASQ1P31415 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CASQ1P31415 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CASQ1P31415 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CASQ1P31415 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CASQ1P31415 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CASQ1P31415 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CASQ1P31415 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CASQ1P31415 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CASQ1P31415 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CASQ1P31415 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CASQ1P31415 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CASQ1P31415 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CASQ1P31415 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CASQ1P31415 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CASQ1P31415 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CASQ1P31415 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CASQ1P31415 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CASQ1P31415 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CASQ1P31415 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CASQ1P31415 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CASQ1P31415 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CASQ1P31415 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CASQ1P31415 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CASQ1P31415 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CASQ1P31415 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CASQ1P31415 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CASQ1P31415 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CASQ1P31415 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CASQ1P31415 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CASQ1P31415 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CASQ1P31415 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CASQ1P31415 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CASQ1P31415 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CASQ1P31415 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
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