Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HOXC13P31276 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HOXC13P31276 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXC13P31276 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXC13P31276 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXC13P31276 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXC13P31276 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXC13P31276 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXC13P31276 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXC13P31276 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXC13P31276 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXC13P31276 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXC13P31276 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXC13P31276 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXC13P31276 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HOXC13P31276 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HOXC13P31276 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HOXC13P31276 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXC13P31276 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXC13P31276 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXC13P31276 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXC13P31276 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXC13P31276 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXC13P31276 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXC13P31276 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXC13P31276 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXC13P31276 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXC13P31276 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXC13P31276 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXC13P31276 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXC13P31276 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXC13P31276 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXC13P31276 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXC13P31276 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXC13P31276 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXC13P31276 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXC13P31276 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXC13P31276 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXC13P31276 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXC13P31276 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXC13P31276 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXC13P31276 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXC13P31276 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXC13P31276 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXC13P31276 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXC13P31276 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXC13P31276 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXC13P31276 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXC13P31276 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXC13P31276 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXC13P31276 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXC13P31276 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXC13P31276 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXC13P31276 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXC13P31276 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXC13P31276 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXC13P31276 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXC13P31276 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HOXC13P31276 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HOXC13P31276 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HOXC13P31276 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HOXC13P31276 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HOXC13P31276 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HOXC13P31276 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HOXC13P31276 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXC13P31276 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXC13P31276 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXC13P31276 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXC13P31276 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXC13P31276 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXC13P31276 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXC13P31276 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXC13P31276 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXC13P31276 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXC13P31276 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXC13P31276 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXC13P31276 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXC13P31276 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXC13P31276 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXC13P31276 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXC13P31276 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXC13P31276 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXC13P31276 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXC13P31276 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXC13P31276 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXC13P31276 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXC13P31276 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXC13P31276 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXC13P31276 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXC13P31276 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOXC13P31276 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOXC13P31276 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOXC13P31276 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOXC13P31276 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
HOXC13P31276 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOXC13P31276 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOXC13P31276 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOXC13P31276 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOXC13P31276 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXC13P31276 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms