Protein–RNA interactions for Protein: P31270

HOXA11, Homeobox protein Hox-A11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA11P31270 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HOXA11P31270 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HOXA11P31270 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
HOXA11P31270 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
HOXA11P31270 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HOXA11P31270 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HOXA11P31270 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HOXA11P31270 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HOXA11P31270 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HOXA11P31270 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HOXA11P31270 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HOXA11P31270 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
HOXA11P31270 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HOXA11P31270 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HOXA11P31270 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HOXA11P31270 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HOXA11P31270 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HOXA11P31270 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HOXA11P31270 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HOXA11P31270 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HOXA11P31270 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HOXA11P31270 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HOXA11P31270 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HOXA11P31270 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HOXA11P31270 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HOXA11P31270 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HOXA11P31270 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HOXA11P31270 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HOXA11P31270 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
HOXA11P31270 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HOXA11P31270 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HOXA11P31270 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
HOXA11P31270 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HOXA11P31270 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HOXA11P31270 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HOXA11P31270 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HOXA11P31270 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HOXA11P31270 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HOXA11P31270 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HOXA11P31270 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HOXA11P31270 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HOXA11P31270 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HOXA11P31270 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HOXA11P31270 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HOXA11P31270 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HOXA11P31270 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HOXA11P31270 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HOXA11P31270 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HOXA11P31270 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HOXA11P31270 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HOXA11P31270 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HOXA11P31270 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HOXA11P31270 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HOXA11P31270 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HOXA11P31270 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HOXA11P31270 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HOXA11P31270 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HOXA11P31270 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HOXA11P31270 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HOXA11P31270 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
HOXA11P31270 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HOXA11P31270 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HOXA11P31270 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HOXA11P31270 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HOXA11P31270 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HOXA11P31270 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HOXA11P31270 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HOXA11P31270 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HOXA11P31270 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HOXA11P31270 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HOXA11P31270 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HOXA11P31270 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HOXA11P31270 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HOXA11P31270 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HOXA11P31270 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HOXA11P31270 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HOXA11P31270 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HOXA11P31270 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HOXA11P31270 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HOXA11P31270 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HOXA11P31270 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HOXA11P31270 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HOXA11P31270 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HOXA11P31270 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HOXA11P31270 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HOXA11P31270 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HOXA11P31270 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HOXA11P31270 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HOXA11P31270 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HOXA11P31270 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HOXA11P31270 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
HOXA11P31270 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HOXA11P31270 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HOXA11P31270 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HOXA11P31270 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HOXA11P31270 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HOXA11P31270 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
HOXA11P31270 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
HOXA11P31270 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25■■□□□ 1.59
HOXA11P31270 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms