Protein–RNA interactions for Protein: P30511

HLA-F, HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain F, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-FP30511 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HLA-FP30511 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HLA-FP30511 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HLA-FP30511 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HLA-FP30511 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HLA-FP30511 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HLA-FP30511 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HLA-FP30511 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
HLA-FP30511 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HLA-FP30511 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HLA-FP30511 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HLA-FP30511 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HLA-FP30511 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HLA-FP30511 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HLA-FP30511 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HLA-FP30511 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HLA-FP30511 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HLA-FP30511 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HLA-FP30511 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HLA-FP30511 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HLA-FP30511 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HLA-FP30511 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HLA-FP30511 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HLA-FP30511 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
HLA-FP30511 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HLA-FP30511 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HLA-FP30511 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HLA-FP30511 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
HLA-FP30511 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HLA-FP30511 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HLA-FP30511 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HLA-FP30511 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HLA-FP30511 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HLA-FP30511 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HLA-FP30511 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HLA-FP30511 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HLA-FP30511 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HLA-FP30511 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HLA-FP30511 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HLA-FP30511 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HLA-FP30511 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HLA-FP30511 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HLA-FP30511 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HLA-FP30511 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HLA-FP30511 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HLA-FP30511 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HLA-FP30511 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HLA-FP30511 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HLA-FP30511 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HLA-FP30511 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HLA-FP30511 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HLA-FP30511 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HLA-FP30511 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HLA-FP30511 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HLA-FP30511 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HLA-FP30511 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HLA-FP30511 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HLA-FP30511 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HLA-FP30511 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HLA-FP30511 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HLA-FP30511 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HLA-FP30511 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HLA-FP30511 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HLA-FP30511 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HLA-FP30511 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HLA-FP30511 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
HLA-FP30511 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HLA-FP30511 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HLA-FP30511 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HLA-FP30511 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HLA-FP30511 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HLA-FP30511 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HLA-FP30511 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HLA-FP30511 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HLA-FP30511 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HLA-FP30511 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HLA-FP30511 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
HLA-FP30511 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
HLA-FP30511 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
HLA-FP30511 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
HLA-FP30511 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
HLA-FP30511 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HLA-FP30511 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HLA-FP30511 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HLA-FP30511 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HLA-FP30511 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HLA-FP30511 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HLA-FP30511 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HLA-FP30511 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HLA-FP30511 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HLA-FP30511 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
HLA-FP30511 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HLA-FP30511 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
HLA-FP30511 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HLA-FP30511 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HLA-FP30511 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
HLA-FP30511 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
HLA-FP30511 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HLA-FP30511 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
HLA-FP30511 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms