Protein–RNA interactions for Protein: P29973

CNGA1, cGMP-gated cation channel alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA1P29973 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CNGA1P29973 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CNGA1P29973 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CNGA1P29973 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CNGA1P29973 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CNGA1P29973 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CNGA1P29973 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CNGA1P29973 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CNGA1P29973 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CNGA1P29973 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CNGA1P29973 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CNGA1P29973 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
CNGA1P29973 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
CNGA1P29973 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CNGA1P29973 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CNGA1P29973 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CNGA1P29973 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CNGA1P29973 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CNGA1P29973 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CNGA1P29973 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CNGA1P29973 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CNGA1P29973 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CNGA1P29973 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
CNGA1P29973 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CNGA1P29973 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CNGA1P29973 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CNGA1P29973 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CNGA1P29973 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CNGA1P29973 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CNGA1P29973 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CNGA1P29973 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CNGA1P29973 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CNGA1P29973 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CNGA1P29973 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
CNGA1P29973 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CNGA1P29973 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CNGA1P29973 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CNGA1P29973 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CNGA1P29973 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CNGA1P29973 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CNGA1P29973 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
CNGA1P29973 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CNGA1P29973 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CNGA1P29973 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CNGA1P29973 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CNGA1P29973 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CNGA1P29973 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
CNGA1P29973 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CNGA1P29973 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CNGA1P29973 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CNGA1P29973 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CNGA1P29973 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CNGA1P29973 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CNGA1P29973 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
CNGA1P29973 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CNGA1P29973 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CNGA1P29973 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CNGA1P29973 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CNGA1P29973 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CNGA1P29973 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CNGA1P29973 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CNGA1P29973 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CNGA1P29973 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CNGA1P29973 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CNGA1P29973 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CNGA1P29973 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CNGA1P29973 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CNGA1P29973 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CNGA1P29973 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CNGA1P29973 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CNGA1P29973 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CNGA1P29973 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CNGA1P29973 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CNGA1P29973 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CNGA1P29973 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
CNGA1P29973 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CNGA1P29973 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CNGA1P29973 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
CNGA1P29973 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CNGA1P29973 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CNGA1P29973 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CNGA1P29973 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CNGA1P29973 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
CNGA1P29973 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CNGA1P29973 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CNGA1P29973 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CNGA1P29973 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CNGA1P29973 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CNGA1P29973 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
CNGA1P29973 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CNGA1P29973 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CNGA1P29973 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CNGA1P29973 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CNGA1P29973 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CNGA1P29973 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CNGA1P29973 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CNGA1P29973 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CNGA1P29973 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CNGA1P29973 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CNGA1P29973 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.6 ms