Protein–RNA interactions for Protein: P29373

CRABP2, Cellular retinoic acid-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRABP2P29373 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CRABP2P29373 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CRABP2P29373 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CRABP2P29373 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CRABP2P29373 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CRABP2P29373 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CRABP2P29373 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CRABP2P29373 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CRABP2P29373 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CRABP2P29373 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CRABP2P29373 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CRABP2P29373 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CRABP2P29373 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CRABP2P29373 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CRABP2P29373 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CRABP2P29373 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CRABP2P29373 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CRABP2P29373 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CRABP2P29373 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CRABP2P29373 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CRABP2P29373 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CRABP2P29373 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CRABP2P29373 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CRABP2P29373 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CRABP2P29373 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CRABP2P29373 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CRABP2P29373 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CRABP2P29373 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CRABP2P29373 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CRABP2P29373 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CRABP2P29373 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CRABP2P29373 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CRABP2P29373 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CRABP2P29373 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CRABP2P29373 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CRABP2P29373 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CRABP2P29373 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CRABP2P29373 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CRABP2P29373 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CRABP2P29373 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CRABP2P29373 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CRABP2P29373 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRABP2P29373 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRABP2P29373 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRABP2P29373 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRABP2P29373 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRABP2P29373 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRABP2P29373 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRABP2P29373 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CRABP2P29373 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRABP2P29373 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRABP2P29373 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRABP2P29373 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRABP2P29373 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRABP2P29373 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRABP2P29373 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRABP2P29373 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRABP2P29373 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRABP2P29373 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRABP2P29373 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRABP2P29373 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRABP2P29373 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRABP2P29373 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRABP2P29373 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRABP2P29373 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRABP2P29373 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRABP2P29373 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRABP2P29373 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRABP2P29373 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRABP2P29373 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRABP2P29373 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRABP2P29373 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRABP2P29373 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRABP2P29373 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRABP2P29373 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRABP2P29373 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRABP2P29373 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRABP2P29373 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRABP2P29373 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRABP2P29373 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRABP2P29373 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRABP2P29373 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRABP2P29373 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRABP2P29373 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRABP2P29373 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRABP2P29373 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRABP2P29373 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRABP2P29373 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRABP2P29373 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRABP2P29373 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRABP2P29373 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRABP2P29373 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CRABP2P29373 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CRABP2P29373 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CRABP2P29373 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CRABP2P29373 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CRABP2P29373 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CRABP2P29373 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CRABP2P29373 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CRABP2P29373 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms