Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GJB2P29033 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GJB2P29033 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GJB2P29033 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GJB2P29033 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GJB2P29033 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GJB2P29033 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GJB2P29033 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GJB2P29033 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GJB2P29033 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GJB2P29033 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GJB2P29033 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GJB2P29033 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GJB2P29033 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GJB2P29033 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GJB2P29033 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GJB2P29033 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GJB2P29033 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GJB2P29033 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GJB2P29033 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GJB2P29033 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GJB2P29033 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GJB2P29033 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GJB2P29033 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GJB2P29033 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GJB2P29033 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GJB2P29033 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GJB2P29033 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GJB2P29033 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GJB2P29033 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GJB2P29033 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GJB2P29033 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GJB2P29033 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GJB2P29033 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
GJB2P29033 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
GJB2P29033 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GJB2P29033 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GJB2P29033 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GJB2P29033 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GJB2P29033 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GJB2P29033 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GJB2P29033 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GJB2P29033 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GJB2P29033 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GJB2P29033 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GJB2P29033 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GJB2P29033 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GJB2P29033 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GJB2P29033 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GJB2P29033 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GJB2P29033 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GJB2P29033 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GJB2P29033 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GJB2P29033 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GJB2P29033 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GJB2P29033 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
GJB2P29033 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GJB2P29033 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GJB2P29033 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GJB2P29033 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GJB2P29033 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GJB2P29033 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GJB2P29033 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GJB2P29033 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GJB2P29033 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GJB2P29033 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GJB2P29033 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GJB2P29033 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GJB2P29033 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GJB2P29033 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GJB2P29033 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GJB2P29033 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GJB2P29033 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GJB2P29033 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
GJB2P29033 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GJB2P29033 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GJB2P29033 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
GJB2P29033 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GJB2P29033 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GJB2P29033 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GJB2P29033 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GJB2P29033 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GJB2P29033 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GJB2P29033 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GJB2P29033 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GJB2P29033 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GJB2P29033 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GJB2P29033 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GJB2P29033 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GJB2P29033 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GJB2P29033 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GJB2P29033 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GJB2P29033 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
GJB2P29033 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GJB2P29033 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GJB2P29033 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GJB2P29033 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GJB2P29033 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GJB2P29033 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GJB2P29033 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms