Protein–RNA interactions for Protein: P28906

CD34, Hematopoietic progenitor cell antigen CD34, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD34P28906 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CD34P28906 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CD34P28906 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CD34P28906 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CD34P28906 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CD34P28906 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CD34P28906 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CD34P28906 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CD34P28906 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
CD34P28906 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CD34P28906 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
CD34P28906 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CD34P28906 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CD34P28906 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CD34P28906 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CD34P28906 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CD34P28906 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CD34P28906 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CD34P28906 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CD34P28906 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CD34P28906 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CD34P28906 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CD34P28906 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CD34P28906 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CD34P28906 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CD34P28906 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
CD34P28906 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CD34P28906 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CD34P28906 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CD34P28906 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CD34P28906 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CD34P28906 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CD34P28906 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CD34P28906 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CD34P28906 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CD34P28906 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CD34P28906 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CD34P28906 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CD34P28906 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CD34P28906 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CD34P28906 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CD34P28906 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CD34P28906 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CD34P28906 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CD34P28906 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CD34P28906 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CD34P28906 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CD34P28906 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CD34P28906 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CD34P28906 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CD34P28906 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CD34P28906 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CD34P28906 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CD34P28906 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CD34P28906 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CD34P28906 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CD34P28906 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CD34P28906 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CD34P28906 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CD34P28906 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CD34P28906 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CD34P28906 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CD34P28906 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CD34P28906 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CD34P28906 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CD34P28906 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CD34P28906 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CD34P28906 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CD34P28906 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CD34P28906 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CD34P28906 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CD34P28906 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CD34P28906 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CD34P28906 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CD34P28906 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CD34P28906 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CD34P28906 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CD34P28906 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CD34P28906 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CD34P28906 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CD34P28906 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CD34P28906 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CD34P28906 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CD34P28906 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CD34P28906 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CD34P28906 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CD34P28906 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CD34P28906 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CD34P28906 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CD34P28906 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CD34P28906 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CD34P28906 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CD34P28906 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CD34P28906 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CD34P28906 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CD34P28906 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CD34P28906 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CD34P28906 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CD34P28906 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CD34P28906 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.9 ms