Protein–RNA interactions for Protein: P26842

CD27, CD27 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD27P26842 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CD27P26842 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CD27P26842 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CD27P26842 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CD27P26842 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CD27P26842 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CD27P26842 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CD27P26842 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CD27P26842 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CD27P26842 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CD27P26842 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CD27P26842 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CD27P26842 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CD27P26842 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CD27P26842 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CD27P26842 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CD27P26842 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CD27P26842 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CD27P26842 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CD27P26842 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CD27P26842 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CD27P26842 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CD27P26842 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CD27P26842 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CD27P26842 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CD27P26842 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
CD27P26842 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD27P26842 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD27P26842 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD27P26842 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD27P26842 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CD27P26842 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD27P26842 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD27P26842 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD27P26842 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD27P26842 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD27P26842 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD27P26842 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CD27P26842 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CD27P26842 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CD27P26842 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CD27P26842 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CD27P26842 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CD27P26842 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CD27P26842 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CD27P26842 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CD27P26842 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CD27P26842 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CD27P26842 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CD27P26842 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CD27P26842 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CD27P26842 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CD27P26842 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CD27P26842 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CD27P26842 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CD27P26842 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CD27P26842 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CD27P26842 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CD27P26842 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CD27P26842 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CD27P26842 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CD27P26842 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CD27P26842 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CD27P26842 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CD27P26842 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CD27P26842 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CD27P26842 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CD27P26842 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CD27P26842 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CD27P26842 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CD27P26842 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CD27P26842 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CD27P26842 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CD27P26842 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CD27P26842 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CD27P26842 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CD27P26842 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CD27P26842 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CD27P26842 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CD27P26842 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CD27P26842 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CD27P26842 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CD27P26842 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CD27P26842 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CD27P26842 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CD27P26842 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CD27P26842 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CD27P26842 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CD27P26842 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CD27P26842 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CD27P26842 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CD27P26842 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CD27P26842 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CD27P26842 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CD27P26842 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CD27P26842 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CD27P26842 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CD27P26842 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CD27P26842 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CD27P26842 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms