Protein–RNA interactions for Protein: P26583

HMGB2, High mobility group protein B2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB2P26583 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
HMGB2P26583 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
HMGB2P26583 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
HMGB2P26583 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
HMGB2P26583 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
HMGB2P26583 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
HMGB2P26583 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
HMGB2P26583 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
HMGB2P26583 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
HMGB2P26583 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
HMGB2P26583 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
HMGB2P26583 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
HMGB2P26583 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
HMGB2P26583 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
HMGB2P26583 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
HMGB2P26583 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
HMGB2P26583 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
HMGB2P26583 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
HMGB2P26583 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
HMGB2P26583 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
HMGB2P26583 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
HMGB2P26583 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
HMGB2P26583 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
HMGB2P26583 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
HMGB2P26583 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
HMGB2P26583 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
HMGB2P26583 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
HMGB2P26583 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
HMGB2P26583 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
HMGB2P26583 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
HMGB2P26583 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC29.44■■■□□ 2.3
HMGB2P26583 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
HMGB2P26583 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
HMGB2P26583 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
HMGB2P26583 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
HMGB2P26583 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
HMGB2P26583 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
HMGB2P26583 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
HMGB2P26583 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
HMGB2P26583 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
HMGB2P26583 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
HMGB2P26583 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
HMGB2P26583 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
HMGB2P26583 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
HMGB2P26583 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
HMGB2P26583 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
HMGB2P26583 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
HMGB2P26583 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
HMGB2P26583 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
HMGB2P26583 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
HMGB2P26583 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
HMGB2P26583 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC29.42■■■□□ 2.3
HMGB2P26583 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
HMGB2P26583 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
HMGB2P26583 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
HMGB2P26583 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
HMGB2P26583 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
HMGB2P26583 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
HMGB2P26583 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
HMGB2P26583 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
HMGB2P26583 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
HMGB2P26583 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
HMGB2P26583 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
HMGB2P26583 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
HMGB2P26583 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
HMGB2P26583 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
HMGB2P26583 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
HMGB2P26583 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
HMGB2P26583 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
HMGB2P26583 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
HMGB2P26583 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
HMGB2P26583 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
HMGB2P26583 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
HMGB2P26583 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC29.38■■■□□ 2.29
HMGB2P26583 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
HMGB2P26583 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
HMGB2P26583 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
HMGB2P26583 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
HMGB2P26583 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
HMGB2P26583 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
HMGB2P26583 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
HMGB2P26583 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
HMGB2P26583 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
HMGB2P26583 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
HMGB2P26583 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
HMGB2P26583 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
HMGB2P26583 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
HMGB2P26583 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
HMGB2P26583 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
HMGB2P26583 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
HMGB2P26583 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
HMGB2P26583 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
HMGB2P26583 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
HMGB2P26583 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
HMGB2P26583 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
HMGB2P26583 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
HMGB2P26583 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
HMGB2P26583 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
HMGB2P26583 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
HMGB2P26583 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms