Protein–RNA interactions for Protein: P26572

MGAT1, Alpha-1,3-mannosyl-glycoprotein 2-beta-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MGAT1P26572 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MGAT1P26572 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MGAT1P26572 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MGAT1P26572 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MGAT1P26572 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MGAT1P26572 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MGAT1P26572 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
MGAT1P26572 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MGAT1P26572 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MGAT1P26572 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MGAT1P26572 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MGAT1P26572 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MGAT1P26572 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
MGAT1P26572 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MGAT1P26572 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MGAT1P26572 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MGAT1P26572 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
MGAT1P26572 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MGAT1P26572 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MGAT1P26572 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MGAT1P26572 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MGAT1P26572 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MGAT1P26572 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MGAT1P26572 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MGAT1P26572 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MGAT1P26572 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MGAT1P26572 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MGAT1P26572 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MGAT1P26572 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MGAT1P26572 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MGAT1P26572 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MGAT1P26572 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MGAT1P26572 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MGAT1P26572 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MGAT1P26572 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MGAT1P26572 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MGAT1P26572 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MGAT1P26572 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MGAT1P26572 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MGAT1P26572 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MGAT1P26572 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MGAT1P26572 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MGAT1P26572 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MGAT1P26572 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MGAT1P26572 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
MGAT1P26572 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
MGAT1P26572 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MGAT1P26572 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MGAT1P26572 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
MGAT1P26572 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MGAT1P26572 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MGAT1P26572 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MGAT1P26572 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MGAT1P26572 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MGAT1P26572 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MGAT1P26572 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MGAT1P26572 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MGAT1P26572 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MGAT1P26572 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MGAT1P26572 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MGAT1P26572 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MGAT1P26572 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MGAT1P26572 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MGAT1P26572 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MGAT1P26572 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MGAT1P26572 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MGAT1P26572 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MGAT1P26572 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MGAT1P26572 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
MGAT1P26572 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MGAT1P26572 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MGAT1P26572 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MGAT1P26572 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MGAT1P26572 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MGAT1P26572 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MGAT1P26572 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MGAT1P26572 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MGAT1P26572 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MGAT1P26572 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MGAT1P26572 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MGAT1P26572 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MGAT1P26572 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
MGAT1P26572 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MGAT1P26572 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MGAT1P26572 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MGAT1P26572 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
MGAT1P26572 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MGAT1P26572 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MGAT1P26572 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MGAT1P26572 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MGAT1P26572 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MGAT1P26572 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MGAT1P26572 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MGAT1P26572 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MGAT1P26572 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
MGAT1P26572 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MGAT1P26572 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MGAT1P26572 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MGAT1P26572 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MGAT1P26572 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms