Protein–RNA interactions for Protein: P26440

IVD, Isovaleryl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IVDP26440 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IVDP26440 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
IVDP26440 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IVDP26440 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
IVDP26440 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
IVDP26440 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
IVDP26440 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IVDP26440 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IVDP26440 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IVDP26440 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IVDP26440 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IVDP26440 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
IVDP26440 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IVDP26440 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
IVDP26440 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IVDP26440 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IVDP26440 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IVDP26440 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IVDP26440 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IVDP26440 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
IVDP26440 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IVDP26440 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
IVDP26440 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
IVDP26440 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
IVDP26440 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
IVDP26440 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IVDP26440 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IVDP26440 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
IVDP26440 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
IVDP26440 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IVDP26440 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IVDP26440 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IVDP26440 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
IVDP26440 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
IVDP26440 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IVDP26440 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
IVDP26440 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IVDP26440 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
IVDP26440 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
IVDP26440 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
IVDP26440 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
IVDP26440 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
IVDP26440 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
IVDP26440 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
IVDP26440 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
IVDP26440 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
IVDP26440 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
IVDP26440 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
IVDP26440 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IVDP26440 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IVDP26440 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
IVDP26440 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IVDP26440 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IVDP26440 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IVDP26440 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IVDP26440 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IVDP26440 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IVDP26440 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
IVDP26440 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
IVDP26440 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
IVDP26440 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
IVDP26440 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
IVDP26440 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IVDP26440 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IVDP26440 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IVDP26440 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IVDP26440 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
IVDP26440 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IVDP26440 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
IVDP26440 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
IVDP26440 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IVDP26440 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
IVDP26440 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IVDP26440 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
IVDP26440 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
IVDP26440 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
IVDP26440 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IVDP26440 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
IVDP26440 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
IVDP26440 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
IVDP26440 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IVDP26440 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IVDP26440 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
IVDP26440 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
IVDP26440 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
IVDP26440 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
IVDP26440 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IVDP26440 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
IVDP26440 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
IVDP26440 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
IVDP26440 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IVDP26440 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IVDP26440 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
IVDP26440 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
IVDP26440 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
IVDP26440 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IVDP26440 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IVDP26440 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IVDP26440 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IVDP26440 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms