Protein–RNA interactions for Protein: P26006

ITGA3, Integrin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3P26006 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGA3P26006 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGA3P26006 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGA3P26006 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGA3P26006 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGA3P26006 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGA3P26006 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGA3P26006 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGA3P26006 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGA3P26006 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGA3P26006 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGA3P26006 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGA3P26006 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGA3P26006 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGA3P26006 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGA3P26006 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGA3P26006 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGA3P26006 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGA3P26006 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGA3P26006 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGA3P26006 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGA3P26006 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGA3P26006 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGA3P26006 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGA3P26006 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGA3P26006 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGA3P26006 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGA3P26006 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGA3P26006 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGA3P26006 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGA3P26006 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGA3P26006 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGA3P26006 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGA3P26006 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGA3P26006 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGA3P26006 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGA3P26006 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGA3P26006 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ITGA3P26006 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ITGA3P26006 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ITGA3P26006 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ITGA3P26006 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ITGA3P26006 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
ITGA3P26006 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ITGA3P26006 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ITGA3P26006 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ITGA3P26006 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ITGA3P26006 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ITGA3P26006 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ITGA3P26006 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ITGA3P26006 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ITGA3P26006 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ITGA3P26006 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ITGA3P26006 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ITGA3P26006 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ITGA3P26006 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ITGA3P26006 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ITGA3P26006 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ITGA3P26006 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
ITGA3P26006 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ITGA3P26006 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ITGA3P26006 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ITGA3P26006 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ITGA3P26006 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ITGA3P26006 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ITGA3P26006 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ITGA3P26006 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ITGA3P26006 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
ITGA3P26006 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ITGA3P26006 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ITGA3P26006 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ITGA3P26006 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ITGA3P26006 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ITGA3P26006 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ITGA3P26006 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ITGA3P26006 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ITGA3P26006 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ITGA3P26006 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ITGA3P26006 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ITGA3P26006 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ITGA3P26006 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ITGA3P26006 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ITGA3P26006 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ITGA3P26006 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ITGA3P26006 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ITGA3P26006 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ITGA3P26006 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ITGA3P26006 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ITGA3P26006 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ITGA3P26006 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ITGA3P26006 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ITGA3P26006 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ITGA3P26006 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ITGA3P26006 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ITGA3P26006 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ITGA3P26006 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ITGA3P26006 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ITGA3P26006 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ITGA3P26006 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ITGA3P26006 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms