Protein–RNA interactions for Protein: P25788

PSMA3, Proteasome subunit alpha type-3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA3P25788 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PSMA3P25788 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PSMA3P25788 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PSMA3P25788 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PSMA3P25788 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PSMA3P25788 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PSMA3P25788 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PSMA3P25788 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PSMA3P25788 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PSMA3P25788 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PSMA3P25788 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PSMA3P25788 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PSMA3P25788 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PSMA3P25788 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PSMA3P25788 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PSMA3P25788 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PSMA3P25788 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PSMA3P25788 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PSMA3P25788 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PSMA3P25788 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PSMA3P25788 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PSMA3P25788 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PSMA3P25788 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PSMA3P25788 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PSMA3P25788 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PSMA3P25788 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PSMA3P25788 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PSMA3P25788 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PSMA3P25788 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PSMA3P25788 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PSMA3P25788 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PSMA3P25788 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PSMA3P25788 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PSMA3P25788 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PSMA3P25788 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PSMA3P25788 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PSMA3P25788 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PSMA3P25788 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PSMA3P25788 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PSMA3P25788 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PSMA3P25788 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PSMA3P25788 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PSMA3P25788 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PSMA3P25788 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PSMA3P25788 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PSMA3P25788 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PSMA3P25788 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PSMA3P25788 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PSMA3P25788 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PSMA3P25788 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PSMA3P25788 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PSMA3P25788 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PSMA3P25788 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PSMA3P25788 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PSMA3P25788 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PSMA3P25788 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PSMA3P25788 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PSMA3P25788 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PSMA3P25788 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PSMA3P25788 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PSMA3P25788 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PSMA3P25788 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PSMA3P25788 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PSMA3P25788 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PSMA3P25788 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PSMA3P25788 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PSMA3P25788 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PSMA3P25788 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PSMA3P25788 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PSMA3P25788 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PSMA3P25788 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PSMA3P25788 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PSMA3P25788 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PSMA3P25788 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PSMA3P25788 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PSMA3P25788 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PSMA3P25788 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PSMA3P25788 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PSMA3P25788 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSMA3P25788 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSMA3P25788 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSMA3P25788 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSMA3P25788 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSMA3P25788 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSMA3P25788 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSMA3P25788 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSMA3P25788 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSMA3P25788 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSMA3P25788 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSMA3P25788 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSMA3P25788 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSMA3P25788 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSMA3P25788 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSMA3P25788 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSMA3P25788 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSMA3P25788 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSMA3P25788 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSMA3P25788 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSMA3P25788 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSMA3P25788 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms