Protein–RNA interactions for Protein: P25774

CTSS, Cathepsin S, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSSP25774 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CTSSP25774 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CTSSP25774 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CTSSP25774 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CTSSP25774 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CTSSP25774 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CTSSP25774 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CTSSP25774 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CTSSP25774 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CTSSP25774 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CTSSP25774 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CTSSP25774 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CTSSP25774 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CTSSP25774 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CTSSP25774 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CTSSP25774 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CTSSP25774 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CTSSP25774 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CTSSP25774 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CTSSP25774 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CTSSP25774 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CTSSP25774 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CTSSP25774 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CTSSP25774 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CTSSP25774 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CTSSP25774 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CTSSP25774 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CTSSP25774 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CTSSP25774 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CTSSP25774 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CTSSP25774 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CTSSP25774 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CTSSP25774 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CTSSP25774 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CTSSP25774 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CTSSP25774 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CTSSP25774 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CTSSP25774 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CTSSP25774 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CTSSP25774 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CTSSP25774 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CTSSP25774 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CTSSP25774 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CTSSP25774 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CTSSP25774 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CTSSP25774 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CTSSP25774 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CTSSP25774 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CTSSP25774 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CTSSP25774 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CTSSP25774 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CTSSP25774 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CTSSP25774 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CTSSP25774 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CTSSP25774 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CTSSP25774 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CTSSP25774 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CTSSP25774 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CTSSP25774 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CTSSP25774 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CTSSP25774 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CTSSP25774 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CTSSP25774 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CTSSP25774 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CTSSP25774 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CTSSP25774 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CTSSP25774 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CTSSP25774 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CTSSP25774 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTSSP25774 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTSSP25774 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTSSP25774 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTSSP25774 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTSSP25774 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTSSP25774 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CTSSP25774 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTSSP25774 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTSSP25774 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTSSP25774 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTSSP25774 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTSSP25774 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTSSP25774 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTSSP25774 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTSSP25774 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTSSP25774 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTSSP25774 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTSSP25774 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTSSP25774 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTSSP25774 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTSSP25774 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTSSP25774 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTSSP25774 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTSSP25774 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTSSP25774 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTSSP25774 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTSSP25774 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTSSP25774 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTSSP25774 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTSSP25774 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CTSSP25774 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms