Protein–RNA interactions for Protein: P23921

RRM1, Ribonucleoside-diphosphate reductase large subunit, humanhuman

Predictions only

Length 792 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRM1P23921 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RRM1P23921 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RRM1P23921 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RRM1P23921 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RRM1P23921 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RRM1P23921 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RRM1P23921 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RRM1P23921 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RRM1P23921 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RRM1P23921 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
RRM1P23921 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RRM1P23921 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RRM1P23921 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
RRM1P23921 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RRM1P23921 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RRM1P23921 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RRM1P23921 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RRM1P23921 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RRM1P23921 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RRM1P23921 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RRM1P23921 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RRM1P23921 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RRM1P23921 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RRM1P23921 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RRM1P23921 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RRM1P23921 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RRM1P23921 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RRM1P23921 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RRM1P23921 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RRM1P23921 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RRM1P23921 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RRM1P23921 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RRM1P23921 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RRM1P23921 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RRM1P23921 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RRM1P23921 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RRM1P23921 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RRM1P23921 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RRM1P23921 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RRM1P23921 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RRM1P23921 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RRM1P23921 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RRM1P23921 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RRM1P23921 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RRM1P23921 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RRM1P23921 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RRM1P23921 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
RRM1P23921 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RRM1P23921 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RRM1P23921 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RRM1P23921 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RRM1P23921 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RRM1P23921 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RRM1P23921 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
RRM1P23921 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RRM1P23921 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RRM1P23921 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RRM1P23921 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RRM1P23921 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
RRM1P23921 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RRM1P23921 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RRM1P23921 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RRM1P23921 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RRM1P23921 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RRM1P23921 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RRM1P23921 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RRM1P23921 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RRM1P23921 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RRM1P23921 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RRM1P23921 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RRM1P23921 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RRM1P23921 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RRM1P23921 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RRM1P23921 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RRM1P23921 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RRM1P23921 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RRM1P23921 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
RRM1P23921 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
RRM1P23921 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RRM1P23921 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RRM1P23921 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RRM1P23921 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RRM1P23921 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RRM1P23921 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RRM1P23921 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RRM1P23921 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RRM1P23921 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RRM1P23921 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RRM1P23921 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RRM1P23921 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RRM1P23921 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RRM1P23921 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RRM1P23921 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
RRM1P23921 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RRM1P23921 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RRM1P23921 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RRM1P23921 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RRM1P23921 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RRM1P23921 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RRM1P23921 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms