Protein–RNA interactions for Protein: P23760

PAX3, Paired box protein Pax-3, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX3P23760 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PAX3P23760 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PAX3P23760 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PAX3P23760 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PAX3P23760 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PAX3P23760 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PAX3P23760 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PAX3P23760 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PAX3P23760 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PAX3P23760 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PAX3P23760 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PAX3P23760 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PAX3P23760 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PAX3P23760 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PAX3P23760 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PAX3P23760 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PAX3P23760 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PAX3P23760 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PAX3P23760 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PAX3P23760 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PAX3P23760 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PAX3P23760 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PAX3P23760 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PAX3P23760 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PAX3P23760 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PAX3P23760 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PAX3P23760 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PAX3P23760 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PAX3P23760 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PAX3P23760 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PAX3P23760 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PAX3P23760 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PAX3P23760 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PAX3P23760 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PAX3P23760 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PAX3P23760 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PAX3P23760 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PAX3P23760 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PAX3P23760 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PAX3P23760 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PAX3P23760 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PAX3P23760 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PAX3P23760 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PAX3P23760 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PAX3P23760 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PAX3P23760 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PAX3P23760 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PAX3P23760 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PAX3P23760 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PAX3P23760 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PAX3P23760 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PAX3P23760 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PAX3P23760 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PAX3P23760 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PAX3P23760 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PAX3P23760 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PAX3P23760 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PAX3P23760 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PAX3P23760 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PAX3P23760 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PAX3P23760 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PAX3P23760 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PAX3P23760 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PAX3P23760 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PAX3P23760 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PAX3P23760 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PAX3P23760 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PAX3P23760 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PAX3P23760 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PAX3P23760 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PAX3P23760 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PAX3P23760 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PAX3P23760 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PAX3P23760 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PAX3P23760 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PAX3P23760 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PAX3P23760 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PAX3P23760 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PAX3P23760 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PAX3P23760 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PAX3P23760 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PAX3P23760 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PAX3P23760 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PAX3P23760 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PAX3P23760 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PAX3P23760 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PAX3P23760 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PAX3P23760 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PAX3P23760 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PAX3P23760 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PAX3P23760 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PAX3P23760 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PAX3P23760 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PAX3P23760 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PAX3P23760 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PAX3P23760 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PAX3P23760 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PAX3P23760 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PAX3P23760 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PAX3P23760 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 551.3 ms