Protein–RNA interactions for Protein: P22894

MMP8, Neutrophil collagenase, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP8P22894 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MMP8P22894 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MMP8P22894 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MMP8P22894 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MMP8P22894 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MMP8P22894 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MMP8P22894 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MMP8P22894 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MMP8P22894 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MMP8P22894 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MMP8P22894 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MMP8P22894 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MMP8P22894 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MMP8P22894 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MMP8P22894 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MMP8P22894 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MMP8P22894 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MMP8P22894 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MMP8P22894 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MMP8P22894 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MMP8P22894 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MMP8P22894 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MMP8P22894 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MMP8P22894 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MMP8P22894 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MMP8P22894 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MMP8P22894 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MMP8P22894 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MMP8P22894 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MMP8P22894 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MMP8P22894 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MMP8P22894 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MMP8P22894 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MMP8P22894 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MMP8P22894 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MMP8P22894 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MMP8P22894 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MMP8P22894 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MMP8P22894 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MMP8P22894 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MMP8P22894 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MMP8P22894 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MMP8P22894 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
MMP8P22894 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MMP8P22894 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MMP8P22894 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MMP8P22894 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MMP8P22894 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MMP8P22894 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MMP8P22894 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MMP8P22894 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MMP8P22894 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MMP8P22894 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MMP8P22894 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MMP8P22894 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MMP8P22894 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MMP8P22894 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MMP8P22894 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MMP8P22894 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MMP8P22894 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MMP8P22894 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MMP8P22894 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MMP8P22894 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MMP8P22894 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MMP8P22894 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MMP8P22894 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MMP8P22894 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MMP8P22894 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
MMP8P22894 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MMP8P22894 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MMP8P22894 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MMP8P22894 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MMP8P22894 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MMP8P22894 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MMP8P22894 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MMP8P22894 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MMP8P22894 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MMP8P22894 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MMP8P22894 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MMP8P22894 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MMP8P22894 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MMP8P22894 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
MMP8P22894 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MMP8P22894 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MMP8P22894 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MMP8P22894 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MMP8P22894 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MMP8P22894 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MMP8P22894 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MMP8P22894 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MMP8P22894 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
MMP8P22894 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MMP8P22894 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MMP8P22894 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MMP8P22894 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MMP8P22894 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MMP8P22894 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MMP8P22894 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MMP8P22894 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
MMP8P22894 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms