Protein–RNA interactions for Protein: P22612

PRKACG, cAMP-dependent protein kinase catalytic subunit gamma, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKACGP22612 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PRKACGP22612 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PRKACGP22612 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PRKACGP22612 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRKACGP22612 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRKACGP22612 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRKACGP22612 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRKACGP22612 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRKACGP22612 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRKACGP22612 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRKACGP22612 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRKACGP22612 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRKACGP22612 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRKACGP22612 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRKACGP22612 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRKACGP22612 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRKACGP22612 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRKACGP22612 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRKACGP22612 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRKACGP22612 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRKACGP22612 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRKACGP22612 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRKACGP22612 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRKACGP22612 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRKACGP22612 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRKACGP22612 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRKACGP22612 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRKACGP22612 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRKACGP22612 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRKACGP22612 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRKACGP22612 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRKACGP22612 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRKACGP22612 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PRKACGP22612 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRKACGP22612 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRKACGP22612 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRKACGP22612 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRKACGP22612 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRKACGP22612 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRKACGP22612 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRKACGP22612 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRKACGP22612 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRKACGP22612 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRKACGP22612 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRKACGP22612 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRKACGP22612 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRKACGP22612 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRKACGP22612 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRKACGP22612 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRKACGP22612 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRKACGP22612 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRKACGP22612 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRKACGP22612 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRKACGP22612 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRKACGP22612 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRKACGP22612 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRKACGP22612 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRKACGP22612 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRKACGP22612 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PRKACGP22612 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PRKACGP22612 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PRKACGP22612 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PRKACGP22612 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PRKACGP22612 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PRKACGP22612 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PRKACGP22612 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PRKACGP22612 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PRKACGP22612 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PRKACGP22612 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PRKACGP22612 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRKACGP22612 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRKACGP22612 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRKACGP22612 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRKACGP22612 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRKACGP22612 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRKACGP22612 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRKACGP22612 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PRKACGP22612 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRKACGP22612 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRKACGP22612 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRKACGP22612 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRKACGP22612 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRKACGP22612 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRKACGP22612 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRKACGP22612 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PRKACGP22612 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PRKACGP22612 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PRKACGP22612 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PRKACGP22612 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PRKACGP22612 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PRKACGP22612 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PRKACGP22612 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PRKACGP22612 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PRKACGP22612 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PRKACGP22612 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PRKACGP22612 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PRKACGP22612 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PRKACGP22612 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PRKACGP22612 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PRKACGP22612 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms