Protein–RNA interactions for Protein: P22223

CDH3, Cadherin-3, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH3P22223 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CDH3P22223 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDH3P22223 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDH3P22223 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDH3P22223 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDH3P22223 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDH3P22223 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDH3P22223 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDH3P22223 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDH3P22223 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDH3P22223 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDH3P22223 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDH3P22223 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDH3P22223 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDH3P22223 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDH3P22223 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDH3P22223 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDH3P22223 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDH3P22223 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDH3P22223 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDH3P22223 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDH3P22223 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDH3P22223 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDH3P22223 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDH3P22223 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDH3P22223 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDH3P22223 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDH3P22223 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDH3P22223 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CDH3P22223 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDH3P22223 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDH3P22223 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDH3P22223 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDH3P22223 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDH3P22223 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDH3P22223 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDH3P22223 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDH3P22223 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDH3P22223 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDH3P22223 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDH3P22223 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDH3P22223 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDH3P22223 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDH3P22223 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDH3P22223 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDH3P22223 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDH3P22223 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CDH3P22223 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDH3P22223 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDH3P22223 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDH3P22223 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDH3P22223 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDH3P22223 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDH3P22223 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDH3P22223 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDH3P22223 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDH3P22223 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDH3P22223 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDH3P22223 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDH3P22223 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDH3P22223 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDH3P22223 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDH3P22223 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDH3P22223 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDH3P22223 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDH3P22223 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDH3P22223 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDH3P22223 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDH3P22223 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDH3P22223 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDH3P22223 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDH3P22223 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CDH3P22223 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CDH3P22223 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDH3P22223 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDH3P22223 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDH3P22223 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDH3P22223 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDH3P22223 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDH3P22223 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDH3P22223 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDH3P22223 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDH3P22223 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDH3P22223 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDH3P22223 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDH3P22223 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDH3P22223 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDH3P22223 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDH3P22223 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDH3P22223 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDH3P22223 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDH3P22223 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDH3P22223 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDH3P22223 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDH3P22223 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDH3P22223 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CDH3P22223 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CDH3P22223 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDH3P22223 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDH3P22223 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms