Protein–RNA interactions for Protein: P21810

BGN, Biglycan, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BGNP21810 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BGNP21810 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BGNP21810 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BGNP21810 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BGNP21810 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BGNP21810 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BGNP21810 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BGNP21810 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BGNP21810 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BGNP21810 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BGNP21810 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BGNP21810 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BGNP21810 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BGNP21810 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BGNP21810 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BGNP21810 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BGNP21810 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BGNP21810 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BGNP21810 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BGNP21810 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BGNP21810 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BGNP21810 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BGNP21810 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BGNP21810 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BGNP21810 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BGNP21810 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BGNP21810 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
BGNP21810 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BGNP21810 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BGNP21810 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BGNP21810 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BGNP21810 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BGNP21810 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BGNP21810 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BGNP21810 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BGNP21810 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BGNP21810 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BGNP21810 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BGNP21810 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BGNP21810 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BGNP21810 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BGNP21810 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BGNP21810 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BGNP21810 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BGNP21810 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BGNP21810 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BGNP21810 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BGNP21810 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BGNP21810 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BGNP21810 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BGNP21810 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BGNP21810 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
BGNP21810 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BGNP21810 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BGNP21810 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BGNP21810 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BGNP21810 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
BGNP21810 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BGNP21810 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BGNP21810 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BGNP21810 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BGNP21810 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BGNP21810 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BGNP21810 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BGNP21810 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BGNP21810 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BGNP21810 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BGNP21810 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
BGNP21810 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BGNP21810 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BGNP21810 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BGNP21810 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BGNP21810 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BGNP21810 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BGNP21810 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BGNP21810 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BGNP21810 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BGNP21810 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BGNP21810 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BGNP21810 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BGNP21810 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BGNP21810 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BGNP21810 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BGNP21810 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BGNP21810 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BGNP21810 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BGNP21810 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BGNP21810 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BGNP21810 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BGNP21810 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BGNP21810 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BGNP21810 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BGNP21810 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BGNP21810 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
BGNP21810 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BGNP21810 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BGNP21810 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BGNP21810 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BGNP21810 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BGNP21810 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms